获得DNA的反向（互补）序列

作者: 今天没回家 | 来源:发表于2021-01-14 19:35 被阅读0次

本方法依赖于emboss，安装方法:

如果未安装
conda install -c bioconda emboss
vi test.fa
>123
AGCTAGCTAAAA
>456
AAAATTTTCCCC

使用方法：

反向互补：
revseq -sequence test.fa -outseq output.fa -notag

cat output.fa
>123
TTTTAGCTAGCT
>456
GGGGAAAATTTT

反向不互补：
revseq -sequence test.fa -outseq output.fa -notag -nocomplement

cat output.fa
>123
AAAATCGATCGA
>456
CCCCTTTTAAAA

互补不反向：
revseq -sequence test.fa -outseq output.fa -notag -noreverse

cat output.fa
>123
TCGATCGATTTT
>456
TTTTAAAAGGGG

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获得DNA的反向（互补）序列
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2020-07-07
本工作目录下的sample_dna.txt文件的DNA序列弄互补链

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