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在线作图|如何绘制一张三元相图

在线作图|如何绘制一张三元相图

作者: 维凡生物 | 来源:发表于2021-09-09 09:09 被阅读0次

    三元相图

    三元相图即三元系统的相图,三元系统是包括三个独立单元的系统。三元相图有三个变量,且三个变量之和为常数,常以一个等边三角形坐标系中的某点来表示三个变量之间的比例关系。等边三角形内任意一点到三角形三边的距离之和等于其中一边上的高(常数);过等边三角形内任意一点分别向三条边作平行线,按顺时针方向或逆时针方向读取平行线在各边所截取之三条线段,三条线段之和等于该等边三角形任一边之长(常数)。在微生物分析中,三元相图是常被用做展示三组数据间两两比较的关系(如物种丰度、相对基因表达等)的可视化图表之一。


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    TUTU网站工具使用
    TUTU云工具可以画,绘制三元相图的方法如下:
    ①登录网址:www.cloudtutu.com(推荐使用360或者谷歌浏览器)
    ②输入用户名和密码(已经为填好了),输入验证码后即可登录;
    ③登录后在全部工具那一栏找到三元相图,点击进入;
    ④请按照界面右侧的说明书或者下文进行操作~

    上传文件

    ※目前平台仅支持.txt(制表符分隔)文本文件或者.csv文件的文件上传。(平台可对不规范的数据格式进行部分处理,但还是请您尽量按照示例数据的格式调整数据,以便机器可以识别)
    a)准备两个数据矩阵(形式参照示例数据,如微生物物种丰度表、基因表达量矩阵、代谢物含量表等等);
    b)表格需要带表头和列名。表格一:每一列为样本名(只能有3列),每一行为各种指标数据名,例如OTU,基因ID、代谢物名称等;表格二:表格一的指标数据名(如OTU)对应的分组名称
    c)重要:请提交txt(制表符分隔)文本文件。操作方法为:全选excel中的所有内容(ctrl+A),复制到记事本中,将记事本文件另存后点击“上传”按钮上传该文件。


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    参数设置

    无参数设置

    下载文件

    点击“运行”开始作图,点击“下载”保存PDF格式的矢量图。PDF格式的文件可通过矢量图编辑工具进行编辑。

    作图后处理

    TUTU云平台提供的是PDF格式的矢量图,可通过矢量图处理软件进行编辑和调整(如:文字字体,文字大小,图片分辨率等)。

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