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orthmcl安装遇到的问题

orthmcl安装遇到的问题

作者: 操控者 | 来源:发表于2019-06-29 19:04 被阅读0次

    刚开始对mysql一无所知,最后通过sudo apt-get install mysql-server和sudo apt-get install mysql-client和sudo apt-get install mysql libmysql client-dev(前两个没问题,这句代码执行不成功,但貌似mysql安装成功了)

    mysql的一些问题见mysql常用命令

    之后开始用cpanm安装一些perl模块( perl模块作用的作用是连接mysql和othomcl pipe line)安装perl包中的DBI时出错了,怪我英语不好,没看懂,那个出错信息应该是缺make这个东西,可以通过sudo apt-get install make来安装。make是编译安装时需要的东西(我是菜鸟,make是啥也不太清楚,有些软件可以通过./configure    make      make install 三步走来安装)据简书上的“耗仔”前辈的文章“寻找同源基因工具Orhomcl与OrhoFinder的安装与使用”(百度Orhomcl排在第一位的就是此文章)提示: perl模块如果不能一次性安装,则需要一个一个安装,如果还不行,就用cpan cpanm apt-get conda 这几个换着试试。

    sudo ubuntu-drivers autoinstall  解决无法正常关机的问题。

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