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单细胞36计之10笑里藏刀---使用CellSelector自动

单细胞36计之10笑里藏刀---使用CellSelector自动

作者: Seurat_Satija | 来源:发表于2021-04-01 08:59 被阅读0次

第十计 笑里藏刀
比喻外表和气而内心阴险。

除了返回单元格名称的向量外,CellSelector()还可以获取所选单元格并为其分配新的标识,返回具有已设置标识类的Seurat对象。这是通过将用于制作图的Seurat对象CellSelector()`以及一个identity类传递给此对象的。例如,我们将选择与之前相同的一组单元格,并将其标识类设置为“ selected”

pbmc3k.final <- CellSelector(plot = plot, object = pbmc3k.final, ident = "selected")
image
levels(pbmc3k.final)
## [1] "selected"     "Naive CD4 T"  "Memory CD4 T" "CD14+ Mono"   "B"           
## [6] "CD8 T"        "FCGR3A+ Mono" "NK"           "Platelet"

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