空间单细胞分析揭示高水平波形蛋白巨噬细胞在肝癌微环境中的免疫抑制

作者，Evil Genius

本周课程全部结束，单细胞空间外显子，希望大家好好学习，一篇20多分的文章，基本上去哪个单位都没有什么阻力。

现在是单细胞+时代

今日参考文献，我们国人发的啊，复旦大学的，大家也赶紧发~~~

肝细胞癌(HCC)的肿瘤微环境异质性

知识积累

• 肿瘤和靶向药物：atezolizumab联合贝伐单抗已被确定为晚期HCC4的一线治疗方案。然而，总体缓解率低于50%，这表明相当大比例的晚期HCC患者无法从现有的治疗方法中获益。
• 单细胞RNA测序(scRNA-seq)已被广泛用于解剖肿瘤免疫微环境(TIME)和鉴定新的细胞群对肿瘤进展和免疫治疗耐药的反应。
• HCC样本之间的空间异质性和复杂的细胞-细胞相互作用模块。

结果1、HCC空间单细胞表型图谱

• 细胞分割 + 空间图谱

  
  

• 免疫浸润的近距离物理接近对预后至关重要

  
  

结果2、空间模式对HCC患者的预后进行分层

• 基于功能生态位的聚类能更好地解释肿瘤间异质性和分层预后。
• 肿瘤类型TP-p53与复发风险显著升高相关，与所有其他患者相比，具有不同的临床结果
• 细胞核中异常p53的积累可能导致HCC的进展
• 两个结构相似但空间位置不同的生态位可能具有不同的特征

• 信号多样化的肿瘤可能具有不同的生长方式和空间组织

  
  
  

结果3、SPs的空间、基因组和分子特征

• 基于空间细胞-细胞相互作用生态位

  
  

结果4、巨噬ge_vim⁺细胞在HCC中的进展作用

• 巨噬ge_vim⁺细胞比例越高，预后越差
• 巨噬ge_vim⁺细胞及其与Treg细胞的相互作用在HCC中具有进展作用
  

结果5、VIM^high巨噬细胞与Treg细胞在HCC中的共定位

• EMT是肿瘤细胞转移前的一个过程。VIM^high巨噬细胞和Treg细胞的共定位，并提示这种共定位可能有助于HCC的进展。
  

结果6、VIM^high巨噬细胞通过白细胞介素-1β增强Treg细胞抑制

• 细胞互作

  
  

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