生信入门合集:
生信入门第一课:VirtualBox安装Ubuntu虚拟机
生信入门第二课:RNA-seq生信分析环境搭建-conda及常用软件安装
生信入门第三课:Linux操作系统简介及生信分析常用30个命令
生信入门第四课:生物信息学常用编程语言R和Python简介
生信入门第五课:Illumina边合成边测序原理
生信入门第六课:测序下机数据fastq文件介绍
生信入门第七课:使用FastQC软件进行测序原始fastq数据质控
生信入门第八课:RNA-seq比对、定量和差异分析
生信入门第九课:PCA、相关性、热图和火山图及代码详解
生信入门第十课:Clusterprofiler GO和KEGG富集分析R代码详解
生信入门第十一课:基因集富集分析( Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)原理和R代码
生信入门第十二课:用Cytoscape绘制PPI网络图并使用cytohubba识别hub基因
第一步下载geo数据集文件(原始数据)
数据下载是生信技能树[生信爆款入门课程]GEO数据挖掘的第一步。为拓展课堂所学知识,现在对他们做下练习总结。 数据...
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之前写的的CHIP-seq和RNA-seq很多练习的数据都是从GEO数据库下载的。但是从来没有细致的了解过GEO这...
用探针的表达量来反映基因的表达量。 知识点 1、GEO Datasets包括: 样本:以GSM开头 平台(手段):...
GEO是目前常用的数据库中收纳数据量最为全面的数据库之一,我们本次基于GEO数据开展一篇生信类型的文章,进行解读、...
本文讲的是aglient芯片原始数据的处理,参考资料是limma 的userguide文档。GEO数据库下载的表达...
GEO数据上传的详细步骤演示 想必很多老师、同学们对转录组相关数据如何上传至GEO数据库存在困惑,本篇整理了GEO...
本文标题:生信入门第十三课:RNA-seq原始数据上传到GEO数据库详细步
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