果子学生信 TCGA数据库构建生存预测模型之lasso回归
果子学生信TCGA数据库构建生存预测模型之lasso回归
本文内容简介:包括应用TCGA数据预处理,应用LASSO回归筛选变量,构建多基因预测模型,绘制风险因子关联图,时间...
1.准备输入数据 2.构建lasso回归模型 输入数据是表达矩阵(仅含tumor样本)和对应的生死。 3.模型预测...
花花写于2020-02-02,看似雄赳赳气昂昂,其实不难。我们是R语言的应用者,不是开发者,所以诸如差异分析,富集...
生存模型的构建方法包括:1. Lasso回归;2. Cox多因素回归;3. 随机森林;4. 支持向量机 可以把lo...
lasso回归 1.准备输入数据 2.构建lasso回归模型 输入数据是表达矩阵(仅含tumor样本)和每个病人对...
lm()即linear model线性模型函数,用来建立OLS回归模型 OLS线性回归 LASSO回归 LASSO...
花花写于2020-02-03 本文使用lasso回归构建了生存模型,后绘制ROC曲线,与上一节差别是这次的ROC曲...
1. 简介 随机森林是机器学习中的一种分类算法,这个算法在之前分享的TCGA生存模型的构建以及模型预测和评估[ht...
记录在TCGA数据集构建机器学习模型预测患者亚型,然后在geo数据集检验。 假如我们在TCGA数据集上构建出亚型,...
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