一、理解TCGA数据中的甲基化位点

甲基化是什么？启动子是什么？甲基化（或者CpG岛）是如何影响基因表达的？

人的甲基化、基因结构、启动子的一些概念 - 简书 (jianshu.com)

甲基化位点和 染色体、转录本、基因组、CpG的关系：

1> 染色体
2> 转录本：1stExon 3'UTR 5'UTR Body IGR TSS1500 TSS200
3> 基因组：Coding Non-coding Intergenic
4> CpG岛：island opensea shelf shore

甲基化芯片注释中的CpG shores, open sea 是什么 - 简书 (jianshu.com)

二、甲基化的临床应用

表观遗传学: DNA甲基化 - 简书 (jianshu.com)

三、甲基化分析

甲基化芯片的一般分析流程 - 知乎 (zhihu.com)
甲基化芯片数据的差异分析 - 简书 (jianshu.com)