一、理解TCGA数据中的甲基化位点
甲基化是什么?启动子是什么?甲基化(或者CpG岛)是如何影响基因表达的?
人的甲基化、基因结构、启动子的一些概念 - 简书 (jianshu.com)
甲基化位点和 染色体、转录本、基因组、CpG的关系:
1> 染色体
2> 转录本:1stExon 3'UTR 5'UTR Body IGR TSS1500 TSS200
3> 基因组:Coding Non-coding Intergenic
4> CpG岛:island opensea shelf shore
甲基化芯片注释中的CpG shores, open sea 是什么 - 简书 (jianshu.com)
二、甲基化的临床应用
表观遗传学: DNA甲基化 - 简书 (jianshu.com)
三、甲基化分析
甲基化芯片的一般分析流程 - 知乎 (zhihu.com)
甲基化芯片数据的差异分析 - 简书 (jianshu.com)
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