生信学习笔记Day4

作者: yhh_hygge | 来源:发表于2020-03-25 21:48 被阅读0次

一.认识R和Rstudio

  • R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。
  • R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。
  • RStudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。


    俺的Rstudio界面

作图说简单也简单,只需要知道图的名字,知道用的什么R包即可自行探索;说难也难,别人的代码套在自己的数据上,需要一定的R语言功底和解决报错的能力。——生信星球

  • 这话说的是实话,所以一个良好的编程功底才是成为一个计算生物学家的前提,不然永远就在实验生物学家背后跟着吧!

二.设置字体大小

某种意义上,这一步很重要,不然像我这种老年兔,看一会电脑,眼睛就花的不行。


字体设置

三.R语言基本操作

1.用Rproject管理工作目录

所谓工作目录就是默认的读取和储存位置,也就是说,R语言只能和一个文件夹进行互动,这个文件夹非常重要,做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑,找不到。——生信星球

  • 养成良好习惯,从我做起。

正常情况下关于工作目录的介绍是:

  • 设置工作目录:setwd()
  • 查看工作目录:getwd()

2.显示文件列表

dir()
list.files()

3.加减乘除

sqrt() #开根号
log10(100)#结果为2

4.赋值

赋值符号用<-,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号

5.删除变量

rm(x)

6.列出历史命令

history()
相当于鼠标单击右上角的history标签

image

当你双击某个命令,他就会跳到你的控制台大于号后面了,可以修改后运行。

7.清空控制台

ctrl+1

控制台被清空喽

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