生信学习笔记Day4

作者: yhh_hygge | 来源:发表于2020-03-25 21:48 被阅读0次

    一.认识R和Rstudio

    • R是一种编程语言,也是统计计算和绘图的环境,它汇集了许多函数,能够提供强大的功能。
    • R语言软件界面简陋,通常不直接使用,而是用图形界面的Rstudio。
    • RStudio是免费提供的开源集成开发环境(IDE)。RStudio提供了一个具有很多功能的环境,使R更容易使用,是在终端中使用R的绝佳选择。


      俺的Rstudio界面

    作图说简单也简单,只需要知道图的名字,知道用的什么R包即可自行探索;说难也难,别人的代码套在自己的数据上,需要一定的R语言功底和解决报错的能力。——生信星球

    • 这话说的是实话,所以一个良好的编程功底才是成为一个计算生物学家的前提,不然永远就在实验生物学家背后跟着吧!

    二.设置字体大小

    某种意义上,这一步很重要,不然像我这种老年兔,看一会电脑,眼睛就花的不行。


    字体设置

    三.R语言基本操作

    1.用Rproject管理工作目录

    所谓工作目录就是默认的读取和储存位置,也就是说,R语言只能和一个文件夹进行互动,这个文件夹非常重要,做不好就会导致你的脚本、文件、图片各种乱跑,找不到。——生信星球

    • 养成良好习惯,从我做起。

    正常情况下关于工作目录的介绍是:

    • 设置工作目录:setwd()
    • 查看工作目录:getwd()

    2.显示文件列表

    dir()
    list.files()
    

    3.加减乘除

    sqrt() #开根号
    log10(100)#结果为2
    

    4.赋值

    赋值符号用<-,这是小于号加上减号,也可以按Alt加上减号

    5.删除变量

    rm(x)

    6.列出历史命令

    history()
    相当于鼠标单击右上角的history标签

    image

    当你双击某个命令,他就会跳到你的控制台大于号后面了,可以修改后运行。

    7.清空控制台

    ctrl+1

    控制台被清空喽

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