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通过Image J计算灰度值

通过Image J计算灰度值

作者: 队长的生物实验室 | 来源:发表于2022-08-12 17:50 被阅读0次

    ImageJ是一款基于 java的,由 National Institutes of Health(NIH)开发的一款功能强大的图像处理软件,在科研中应用极为广泛。

    ImageJ在科研领域相当重要,2021年被Nature评为十大影响科学的代码。如果你在实验中会接触到图像,ImageJ这个软件应该是必备的科研工具。

    安装
    官方下载网址https://imagej.nih.gov/ij/download.html
    选择适合系统的版本下载,下载好即可运行。

    下载
    使用
    1.打开软件,通过 File→Open 打开要分析的胶图,或直接拖拽胶图至软件即可识别;
    2.如果胶图为黑底白带,则需要反色:点击Edit→Invert,如下图所示,变为白底黑带;
    Invert 白底黑带
    3.将胶图通过Image→Type→8-bit将图片转为8位的灰度图,即从黑到白有256(0~255)种灰色的黑白图片;
    8-bit
    4.将胶图的灰色背景去掉:点击PROCESS→Subtract Background→ Rolling ball radius: 50.0 pixels, 勾选Light Background;
    Subtract Background
    Light Background
    5.用矩形选框工具(工具栏第一个)框选同一行的所有条带,如下所示;


    6.完成框选后,按Ctrl+1,紧接着按Ctrl+3,得到峰形图;
    峰形图
    7.使用直线工具,将所有6个小峰图封闭起来;

    8.选择魔法棒工具,依次点击封闭后的各个小峰,即可得到灰度值。



    灰度值

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