沉浸式阅读Nature——预防新冠，看看Nature怎么做

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1. 前情回顾

之前两期推送：
第一期（省流：ACE2不是SARS-COV-2的唯一靶点，文章仅证明UDCA能降低ACE2表达水平）
第二期（省流：如果要证明熊去氧胆酸通过下调ACE2的表达能够预防新冠还需要加一个隐藏条件：SARS-COV-2不会直接感染肺部，其造成的肺损伤可能是由其他组织感染引起的代偿反应（或者其他间接的机制），这样的话，就算ACE2在肺中表达量低，也不会影响说明熊去氧胆酸在预防新冠方面的作用）

2. 本期内容

本期主要分析文章结果的第一部分：胆汁酸调节胆管细胞ACE2表达量

1. 首先是胆管细胞表达ACE2水平在胆管树中最高
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   如上图a所示，一共有5种细胞被纳入研究：

• 肝内胆管细胞（IHD）
• 胆总管细胞（CBD)
• 胆囊细胞（GB）
• 胆管类器官（COs：IHD,CBD,GB）
• 胆管类器官（COs：IHD,CBD,GB）+胆汁酸（bile acids）

图b是单细胞测序结果的UMAP图，根据算法进行降维后的分群结果，颜色代表不同的细胞类型，距离越近证明细胞的表达谱越相似

图c是基因在细胞中的表达水平，越红表达量越高

结合图b和图c1来看，ACE2主要表达于肝外胆管细胞和加了胆汁酸的COs中（图b负责定性，图c负责定量）

2. 刚刚是mRNA水平，然后再来看蛋白水平染色情况，也表明了胆总管和胆囊中ACE2表达量较高（下图红色表示ACE2表达），而在肝内胆管中却几乎没有红色荧光，印证了单细胞测序的结果

   
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3. 然后做了SARS-COV-2的免疫荧光染色，可以发现胆囊中感染情况是比较严重的，但滑稽的是，胆总管的结果这里并没有放出来 - -!。那么这里可以小问一下，ACE2表达量高，SARS-COV-2的水平一定高吗？

   
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4. 之后，作者又在IHD,CBD和GB类器官中分别加入胆汁酸发现，加入胆汁酸之后组织中的ACE2水平都明显升高（图g），同时，在类器官中也发现类似效果，胆囊本身ACE2水平较高，加了胆汁酸CDCA的胆管类器官表达的ACE2与胆囊表达水平相当，胆囊标志物SOX17也显著升高（图h），免疫荧光表示加入胆汁酸CDCA后，胆管类器官中ACE2表达也会增加（图i）

   
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5. 然后，图b又展示了胆汁酸CDCA处理后的胆管类器官高表达SARS-COV-2蛋白，并且病毒在其中还具有传染性（图c），导致了先天免疫和抗病毒反应应答（相关基因上调，图d）

   
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6. 接下来展示了病毒感染后的死亡细胞的形态特征，产生病毒颗粒、形成病理性空泡和肿胀的线粒体（图e）

   
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那么，有胆汁酸的组织，表达ACE2；没有胆汁酸的组织，不表达ACE2，表明胆汁酸CDCA是ACE2表达所必须的，当然，所有实验都是胆管相关组织器官中进行的，对于在其他组织器官中是否适用，原文目前尚未提及

捋一捋本小节的思路，本文主要从原发组织到类器官，从肝外胆管到肝内胆管，从mRNA到蛋白质水平来验证了ACE2、SARS-CoV-2与CDCA的关系，比较严谨，实验也比较丰富，为后文引出UDCA作出了铺垫

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