image.png因为最近看到一个斑马鱼单细胞的文献,看实验部分的时候,看那斑马鱼品种看得我很懵逼,就索性了解下下咯
TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264; Tg(foxd3:EGFP)zf104
Tg(tph2:mCherry)y227; Tg(gfap:EGFP)mi2001
刚开始的时候Tg我也不懂
后来百度了下
刚好看到有一个文献是讲这方面内容
文献名字是《斑马鱼突变体和转基因鱼系命名规则简介》
文献是Agouti-Related Protein 2 Is a New Player in the Teleost Stress Response System
1.命名原则
Tg-Trangene 转基因,
TgBAC/TgPAC表示用BAC或者PAC制备的转基因
转基因载体整合到斑马鱼基因组中造成的
转基因载体的标准表达式: Tg(promotor:gene)
Tg表示普通转基因,括号内则记录了该载体的最关键特征成分,包括调控元件(例如: 启动子)以及有编码功能的基因,两者用冒号隔开
连续的调控元件或者融合读码框之间用横线连接
受同一调控元件控制的独立读码框之间用逗号隔开
不同读码框受不同调控元件驱动,则采用多组"调控元件: 编码序列"的形式依次描述,用逗号分隔
作者给了个例子
例子
补充
2.阅读的文献里的转基因斑马鱼
TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264; Tg(foxd3:EGFP)zf104
作为一个小白,还去查了mCherry和EGFP是啥,真就这几个字母看了半天啊
Tg-Trangene缩写 表示转基因, TgBAC/TgPAC表示用BAC或者PAC制备的转基因载体
agrp2:Gal4-VP16 agrp2 转录本表达的启动子调控元件, Gal4-VP16 基因的读码框,tlv05表示该机构的鱼系标识。
Tg(foxd3:EGFP)zf104 foxd3转录本表达的启动子调控元件,EGFP基因的读码框
TgBAC(agrp2:Gal4-VP16)tlv05; Tg(UAS:nfsB-mCherry)c264;---为了拿到表达mCherry的Agrp2 pineal cells
Tg(foxd3:EGFP)zf104--为了拿到逼到EGFP 的 pineal neuron cells
Tg(tph2:mCherry)y227---为了拿到mCherry表达的pineal photoreceptors cells
Tg(gfap:EGFP)mi2001--为了拿到EGFP表达的astrocyte 和pineal interstitial cells 松果体间充质细胞
补充在后面
mCherry是一种被广泛用于生物技术作为示踪剂的红色荧光染料,包括分子的标记和细胞组分的定位等。不同于其它从维多利亚水母中分离的GFP蛋白和其它绿色荧光蛋白变体,mCherry以及其它大多数红色荧光蛋白是从珊瑚(Discosoma)中分离出来的蛋白。mCherry因为其颜色和单体分子的光稳定性,比其它荧光蛋白标签更优异,其最大激发光和发射光分别为587nm和610nm。
EGFP,即增强绿色荧光蛋白(Enhanced Green Fluorescent Protein),GFP,即绿色荧光蛋白(Green fluorescent protein)。EGFP是GFP突变系,应用较多的是GFP的突变体:增强型绿色荧光蛋白(EGFP )(64位苯丙一亮),发射出的荧光强度比GFP大6倍以上。 绿色荧光蛋白,是一个由约238个氨基酸组成的蛋白质,从蓝光到紫外线都能使其激发,发出绿色荧光。虽然许多其他海洋生物也有类似的绿色荧光蛋白,但传统上,绿色荧光蛋白(GFP)指首先从维多利亚多管发光水母中分离的蛋白质。
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