下载地址：https://nchc.dl.sourceforge.net/project/openbabel/openbabel/2.4.1/OpenBabel-2.4.1-x86.exe
在windows系统上安装的Open Babel默认情况下是图形界面的，下面就对Open Babel 2.4.1版本的图形界面简单介绍一下。
第一部分是菜单栏，这里主要有“File”，“View”，“Plugin”，“Help”四个菜单栏。
第二部分是输入文件的格式，通过下拉列表可以选择需要转换的输入文件的格式。
第三部分是需要转换的输入文件地址和文件名。
第四部分为输入文件的展示。
第五部分是最重要的部分，这里主要是一些与文件转换相关的参数设置，虽然大部分时候我们只需要使用默认参数即可，当在适当的情况下需要我们调整参数。如是否加氢原子，有时候下载的分子结构中是没有氢原子的，在转换文件格式的时候可以选择是否添加氢原子。
第六部分是输出文件的文件类型。
第七部分是输出文件的位置和文件名，也可以选择不输出到文件，只在第八部分展示。
第八部分是输出文件的展示。
OpenBabel转换一种化学结构文件到另外一种化学结构文件，如转换pdb结构文件到mol2结构的文件。下面就sd文件转换到mol2格式文件为例。
在图中1处选择需要转换的文件格式，这里是sd文件，选择对应的sd格式即可。需要注意的是，无论是输入文件格式还是输出文件格式都是按照字母排序的，可以快速的定位文件格式。
在图中2处通过“…”打开需要转换的文件，如这里需要转换的文件为1.sd，需要注意的是一定要跳转目录到放置文件夹的目录，在选择了文件之后再文件名框的上方会显示文件路径，如这里E:\NDM1\20170630\gaff\campsterol。
在选择了输入文件之后会在图中3处显示文件内容，通过显示的内容可以发现在这里该格式没有任何的氢原子。
输入文件选择之后就开始输出文件的选择，在图中5处选择输出文件的格式，在6处给出输出文件的文件路径和文件名，这里转换成1.mol2文件，放置在于输入文件相同的目录下。
在选择了输入与输出文件之后需要在图中4部分设置相应的转换参数，如这里需要添加氢原子，勾选相应的添加氢原子的参数，并设置添加氢原子使用的是pH7.2的环境。
在设置好输入，输出，转换参数之后，点击图中7处的转换按钮开始转换，转换成功之后会在图中8处显示输出文件的内容，同时提示转换了一个分子，这里只有一个分子结构。
到这里就成功的完成了从sd文件到mol2文件的转换，并自动添加了氢原子。
默认情况下会将输入文件里面的所有分子都转换成对应的输出格式的文件，如果输出格式允许将所有的分子存储为一个文件的话，还将存储在输出文件中去。
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