R语言

1.

R1.png

2.安装R包

install.packages("pheatmap")    #联网下载安装pheatmap包
library("pheatmap")    #将这个pheatmap包加载入R中，回车后没显示就成功
？ pheatmap    #出现pheatmap网页，关于该包的用法

Snipaste_2020-04-02_16-15-51.png

3.对象

R中区分大小写！
不用数字开头

对象.png

对象类型

对象类型.png

对象数据结构

对象数据结构.png
二维数据框.png

4.赋值与注释 <-

a <- 2    #将数字2赋值给变量a，或者也用=，或者->要注意赋值方向

5.运算符

运算符.png

6.访问

$   #访问信息
[1,]   #访问第一行的数据框
[,1]  #访问第一列
[1,2]  #访问第一行的第二列
cars$speed  #访问speed向量的信息

举个例子

举列子.png
再举个例子
分析结果的多维存储.png
将数据保存在变量中，以便查看

7.R的函数

function(对象，选项=)

R的函数.png
函数.png
部分函数.png
没有的函数需要安装R包！

8.工作路径

getwd()    #查看当前R工作的空间目录

工作路径.png

修改工作路径

文件  改变工作路径  选择新的工作路径
dir()    #是列举路径下所有的文件名

更改工作路径不用在读取的时候写一长串，直接写文件名

9.外部数据读取

R不能读取EXCEL格式，所以要转化成为TXT或CSV格式

read.table()   #读取外部TXT文件
read.csv()    #读取外部CSV文件
header=T，row.name=1，sep="\t"   #第一行为标题，第一列是名字，分割

外部数据读取.png
read table.png

读取后最好赋值保存

10.注意

注意.png

11.脚本

脚本.png
编辑器.png

脚本可以用TXT格式打开
常用脚本，举例

rbind(a,c）
cbind(a,c)

cbind： 根据列进行合并，即叠加所有列，m列的矩阵与n列的矩阵cbind()最后变成m+n列，合并前提：cbind(a, c)中矩阵a、c的行数必需相符

rbind： 根据行进行合并，就是行的叠加，m行的矩阵与n行的矩阵rbind()最后变成m+n行，合并前提：rbind(a, c)中矩阵a、c的列数必需相符

常用.png

举例

t(x)    #将行列对调

常用2.png
转置.png

举例

rep()     #重复

重复.png

举例

plot()    #画图

plot.png

12.R绘图

R绘图.png
绘图高低级.png
高绘图.png
绘图函数.png

13.保存输出

数据输出.png

图片输出最好事PDF格式

图片输出.png

或者

pdf()   #新建一个pdf文件，将图片保存在这个PDF中
pheatmap()
dev.off()   #存储后退出

图像输出.png