R语言
1.

2.安装R包
install.packages("pheatmap") #联网下载安装pheatmap包
library("pheatmap") #将这个pheatmap包加载入R中,回车后没显示就成功
? pheatmap #出现pheatmap网页,关于该包的用法

3.对象
R中区分大小写!
不用数字开头

对象类型

对象数据结构


4.赋值与注释 <-
a <- 2 #将数字2赋值给变量a,或者也用=,或者->要注意赋值方向
5.运算符

6.访问
$ #访问信息
[1,] #访问第一行的数据框
[,1] #访问第一列
[1,2] #访问第一行的第二列
cars$speed #访问speed向量的信息
举个例子

再举个例子

将数据保存在变量中,以便查看
7.R的函数
function(对象,选项=)



没有的函数需要安装R包!
8.工作路径
getwd() #查看当前R工作的空间目录

修改工作路径
文件 改变工作路径 选择新的工作路径
dir() #是列举路径下所有的文件名
更改工作路径不用在读取的时候写一长串,直接写文件名
9.外部数据读取
R不能读取EXCEL格式,所以要转化成为TXT或CSV格式
read.table() #读取外部TXT文件
read.csv() #读取外部CSV文件
header=T,row.name=1,sep="\t" #第一行为标题,第一列是名字,分割


读取后最好赋值保存
10.注意

11.脚本


脚本可以用TXT格式打开
常用脚本,举例
rbind(a,c)
cbind(a,c)
cbind: 根据列进行合并,即叠加所有列,m列的矩阵与n列的矩阵cbind()最后变成m+n列,合并前提:cbind(a, c)中矩阵a、c的行数必需相符
rbind: 根据行进行合并,就是行的叠加,m行的矩阵与n行的矩阵rbind()最后变成m+n行,合并前提:rbind(a, c)中矩阵a、c的列数必需相符

举例
t(x) #将行列对调


举例
rep() #重复

举例
plot() #画图

12.R绘图




13.保存输出

图片输出最好事PDF格式

或者
pdf() #新建一个pdf文件,将图片保存在这个PDF中
pheatmap()
dev.off() #存储后退出

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