conda create -n mutmap python=3.5 mutmap
参考基因组（水稻）：reference.fasta
野生型：10079
分离群体混池：Rice_H304-R06_good
mutmap -r reference.fasta -c 10079_1_clean.fq,10079_2_clean.fq -b Rice_H304-R06_good_1.fq,Rice_H304-R06_good_2.fq -n 20 -o example_dir
# -n 20 突变体的个体数量
# -o example_dir 输出位置
# 若需要对fq文件进行修剪，则在最后加上 -T
参考：https://github.com/YuSugihara/MutMap
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本文标题：mutmap
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/byfysrtx.html
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