zcat G-0-5-1-1.fq1.gz | grep -c '^+'
主要为zcat命令可以直接查看.gz压缩文件
一、准备RNA-seq数据 需要参考基因组文件,注释文件,样本的fastq.gz文件 检查fastq.gz是否完整...
a)查看history保存的条数:$HISTSIZE,默认3000 b)查看history保存的文件:cat /r...
前期准备: (1)统计reads_1.fq 文件中共有多少条序列信息 2)输出所有的reads_1.fq文件中的标...
疑问: 当我想要通过VCF文件查看一个突变位点的变异reads支持数时,发现文件展示的DP (total dept...
目录 samtools和picard的排序问题SAM文件中FLAG值的理解SAM文件中那些未比对的reads为什么...
删除文本中多余的东西 文件里的文件名写入ls reads / | sed "s/.gz//g" > specie...
bcl2fastq 产生的文件结果如下(4个lane fastq.gz 文件): 现在要将多个lane 的fast...
查看fastq总体信息 root:~/refs# seqkit stat duplicated-reads.fq....
文件操作: ls ####查看目录中的文件#### ls -F ####查看目录中的文件#### ls -l ##...
SAM文件不但记录了reads详细的mapping信息,还记录了reads的原始信息,内容很是全面。这样很好,...
本文标题:2020-10-21 查看fastq.gz文件中reads条数
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