见链接：https://zhuanlan.zhihu.com/p/264504322
BH算法的公式为：
Q value = p *(m/k)
其中，m是检验的次数，k是这次检验的p value在所有检验中的排名。
例如，我们对10000个基因进行表达差异分析。那么每个基因都会得到一个p value。现在，我要估算每个基因对应的Q value，就可以用以上公式计算。由于检验次数是10000次，理论上m=10000。然后将所有基因的p value从小到到大排序，确定每个基因对应的k值。
如果一个基因对应的p value在10000个基因中排名第一，那么这个基因对应的k=1。如果一个基因对应的p value在 10000个基因中排名第100，那么这个基因对应的k=100。
第二部分参考：https://www.sohu.com/a/326691378_278730?qq-pf-to=pcqq.c2c
问题一：GO和KEGG富集倍数（Fold Enrichment）如何计算 见链接：https://zhuanlan...
感觉tbtools，CJ大神最新开发的几个有料小插件确实大大简化了RNA-seq定量的流程。通过go分析发现过氧化...
1、关于FPKM, RPKM, TPM在RNA-Seq的分析中，对基因或者转录本的reads count数目进行...
RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析 原文链接：RNA-seq中的基因表达量计算和表达差异分析-生物知识...
一直都想写一篇关于go语言中net/http的源码分析和关于Vue在实际开发中遇到的几个问题，但是最近刚从DP跳槽...
RNA-Seq数据标准化方法 oriRNA在RNA-Seq的分析中，我们常用RPKM、FPKM和TPM作为转录组数...
前言 这一部分主要涉及常规RNA-seq的数据分析，提到了常见的数据分析流程。 RNA-seq数据分析 用于分析测...
这里是佳奥，我们继续RNA-Seq分析的结果探究。 第三步，DEG-差异分析。 1 RNA-Seq结果分析：DEG...
关于RNA-seq中的reads count标准化处理的方法汇总，请先看看这篇：当我们在说RNA-seq read...
无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analys...
本文标题：关于RNA-SEQ中GO分析的几个名词
本文链接：https://www.haomeiwen.com/subject/ccawultx.html
网友评论