聘书送达后，只有周诒春因与清华过往的一段纠葛未允，其余五人皆就聘，开始为清华大学筹备出谋划策。根据五位顾问与外交部建议，在校内成立“大学筹备委员会”，曹云祥、张彭春、梅贻琦等为筹备委员。一九二四年十月，《清华大学之工作及组织纲要》，经“筹备大学委员会”之课程及计划组议决通过。
获中外人士好评
一九二五年四月，北洋政府外交部批准了大学筹备委员会提出的《清华大学工作及组织纲要（草案）》，学校随即按照纲要成立了“临时校务委员会”，由曹云祥、张彭春、梅贻琦等十人为委员，由该会负责将清华学校改组成大学部、留美预备部和研究院三部分，并决定到一九二九年旧制学生全部毕业后，留美预备部停办。此后，又制定出详细的“组织大纲”，其学制分为六条：
一，本校设立大学部及留美预备部。
二，凡留美预备部学生毕业后，一律资送赴美留学。该部至民国十八年停办。
三，大学部分本科及大学院（大学院未成立前暂设研究院）。
四，本校学程以学系为单位。
五，大学部本科修业期至少四年，学生毕业后给学士学位。
六，大学院未成立之前暂设研究院，先办国学一门，以后斟酌情形逐渐添办它门，至民国十九年大学院成立后，研究院即行停办。
这个计划，既为董事会接受，又得到中外社会人士的好评。而美国方面，对清华同样抱有造就领袖人才的希望，这同美方当年退款本身的意图正相符合。一九一七年，美国《纽约星期报》发表的〈论华人留学美洲之今昔〉一文，在论述吸收中国学生留美的作用时曾提及：“学成归国之中国少年，一日在中国教育、商业诸界具有势力，即美国之势力一日将为中国历史上操纵一切之元素。此在今日犹有特别意味，盖日本目前正执亚洲之牛耳，然不得谓日本将永执牛耳。”一九二四年三月三十一日，美国众议院外交委员会讨论第二次退还庚子赔款会议中，检查了第一次“退款”办清华学校的“效果”。一些在华多年的美国人“作证”说：退款办清华“可以造成中国的领袖人才，可以使中华民国的基础巩固。”又说，“留美归国的先辈，也有些已经占有重要位置，在政局上很有影响”，“只就目前而论，这番举动，于中国对美关系上，已经发生异常的效验。”
对这样的目的和要求，曹云祥顺时而动，上台后竭力倡导鼓吹，并曾雄心勃勃、豪气冲天地宣称，不但要把清华办成人才的培养基地，还要把清华园变成栽培领袖的摇篮。一九二五年四月，曹云祥于清华大礼堂作〈领袖人才的养成〉演讲，希望清华学生日后能成为领袖型人才，曹说：“有社会团体，即须有领袖；无领袖则不成其为社会团体矣。譬如电机，若无电力，则与无电机同也。为领袖者必有领袖之才。以力服人者，非真人才也。唯以德服人者，始可为社团精神之指挥，而为真领袖也。……为良好公民，须知已；为良好领袖，须知人……今吾国国事之俶扰，国势之阽危，军阀争权，兵匪充薮，士不得安于学，农不得安于耕，工商不得安于市，以无领袖人才之故也。彼欧美列强，国家富强，人民安乐者，是有领袖人才之故也。可知领袖人才，有之则国治，无之则乱。其重要有如此者！吾校岌岌变更学制，提高程度，添设大学部、研究院，实亦亡羊补牢之计；盖欲培养青年学子，成就领袖人才，以供我国之需求，而期挽此狂澜，使政治统一，百废俱兴，人民得以安居乐业，共享和平之福也！”
大学部暂不收女生
经过紧锣密鼓的筹备，一九二五年五月，清华学校大学部和国学研究院国学门正式宣告成立，开始招生。国学研究院国学门招生三十人，“新制”普通科一年级招收学生一二三人，实际报到九十三人，这一批学生被称为清华大学第一级生。此前通过的组织章程中明确规定：“纯以在国内造就今日需用之人材为目的，不为出洋游学之预备。”
同时，为避免产生误会，或个别学生进入校门后充傻装愣无理纠缠，校方特别发表“重要声明”如下：
（一）学生在本大学部肄业完全与留美学额无关，但将来清华举行留学考试时，本校专门科毕业生均得报名应试，凡投考本大学之学生务须明了此项办法以免误会。
（二）本校大学部暂不收录女生。
一九二五年九月，清华具有历史转折意义的新学年开始，曹云祥于开学之日作了热情洋溢的演说，谓：“本学年为新计划开办之纪元。……自今以后，派送留美学生，逐渐减少，新大学学生，陆续增加。故今年招收新大学学生一百三十二名，研究院学员三十名。当时每年仅能招收三十名至五十名而已。四年之后，公开留美考试，并非专派清华学生，凡国立大学毕业之学生，成绩优良，并本所习学科，在社会服务二年者，均可应试。每次考送以三十名为限。曾经当代学界名流讨论决定，故此种新计划，为中国知识界所赞许。”接下来，曹云祥述及预备课程大旨，特别提及国学研究院的创设，谓：“现在中国所谓新教育，大都抄袭欧美各国之教育，欲谋自动，必须本中国文化精神，悉心研究。所以本校同时组织研究院，研究中国考据之法。希望研究院中寻出中国之国魂，犹如日本武士道之魂，新意大利之魂，及各国之国魂。其研究院之详细情形，由研究院主任说明之。”
曹云祥演讲毕，张彭春发言，继之由清华早期历史上具有传奇色彩的人物、时任清华国学研究院主任吴宓登台演讲。──至此，在清华园平空生出的、过渡时期的国学研究院，连同王国维、梁启超等几位大名鼎鼎的导师，首次集体进入清华师生的视野。（待续）
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