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数据读取

数据读取

作者: 芋圆学徒 | 来源:发表于2021-02-04 00:11 被阅读0次

数据读取四大利器

(1)read.table及其同类的read.csv和read.delim

(2)readr包的read_table、read_csv等

(3)data.table包的fread函数

(4)rio包的import函数

他们的比较在小洁老师的简书中有详尽的说明:超有诚意的R语言数据读取指南 - 简书

小洁老师在最后总结到:

对于常见格式,可以先尝试import导入(其实import是根据fread函数写的);

如果失败,再用fread读取,最多是加个参数,理论上就可以成功;

如果还是不行,哈德雷大神写的read_*系列也不是吃素的,拿来试试。

base包有点笨,但他参数多,更灵活,可以作为一个选择。


最后的最后

实在不行,可以使用readLines()将每行作为一个字符串,读取的结果是一个大的字符串向量。

别管三七二十一,先读进来,转化为一个"一列的数据框",然后再分割也是可以的。

关于分割,推荐tidyr::separate()

'''

library(tidyverse)

path=readLines("B cell receptor signaling pathway.csv")

n=str_count(path[1],",")

df=data.frame(x=path)%>%

       separate(x,into=paste0("V",1:(n+1)),sep=",");dim(df)

'''

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