美文网首页
Converting from Seurat to AnnDat

Converting from Seurat to AnnDat

作者: SnorkelingFan凡潜 | 来源:发表于2022-06-26 15:42 被阅读0次

    从rds格式到h5格式
    https://mojaveazure.github.io/seurat-disk/articles/convert-anndata.html

    library(Seurat)
    library(SeuratData)
    library(SeuratDisk)
    
    pbmc3k <- readRDS("pbmc.rds")
    
    SaveH5Seurat(pbmc3k, filename = "pbmc3k.h5Seurat")
    Convert("pbmc3k.h5Seurat", dest = "h5ad")
    
    

    相关文章

      网友评论

          本文标题:Converting from Seurat to AnnDat

          本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/chlgvrtx.html