美文网首页练习题R语言
[R语言练习题]R语言初级测试题

[R语言练习题]R语言初级测试题

作者: 巩翔宇Ibrahimovic | 来源:发表于2020-02-24 16:16 被阅读0次

在学习R的过程中发现,光看书是不行的,看书仅仅停留在理解这个过程,但是我们的最终目的是灵活运用,每天感觉仿佛是看了好多东西,了解了不少,但是自己往后能用到多少,这就是个未知数了,且瞬时记忆的东西过不了多久就会忘记,不如做练习来加深一下印象,毕竟孰能生巧嘛。通过做练习和搬运别人的代码,让我对代码又有了更加深入的理解。

1.创建数据框并自由进行元素的提取

#创建数据框
patientID <- c(1,2,3,4)
age <- c(25,34,28,52)
diabetes <- c("Type1","Type2","Type1","Type1")
status <- c("Poor","Improved","Excellent","Poor")
patientdata <- data.frame(patientID,age,diabetes,status)
#对1,3行或者2-4行进行提取
patientdata[c(1,3),]
patientdata[c(2:4),]
#使用data()查看内置数据集
data(rivers)

2.读入文件并了解文件构成,并将两文件进行合并

#清空当前环境的所有对象
rm(list = ls())
#设置字符串为非因子
options(stringsAsFactors = F)
getwd()
#文件读取
a <- read.table("RunInfo Table.txt",sep = "\t",header = T)
b <- read.csv("sample.csv",header = T)
#merge及准备
colnames(a)
colnames(b)
d <- merge(a,b,by.x = "Sample_Name",by.y = "Accession")
e <- d[,c("MBytes","Title")]
#保存为Rdata方便下一步进行
save(e,file = "input.Rdata")

3.对字符串进行拆分统计并画图

rm(list = ls())
options(stringsAsFactors = F)
load(file = "input.Rdata")
#将Title字符串中的第三个元素作为plate
plate=unlist(lapply(e[,2],function(x){
  # x=e[1,2]
  x
  strsplit(x,'_')[[1]][3]
  
}))
#返回list
class(strsplit(e[,2],'_'))
#对plate的内容进行统计
table(plate)
#构建箱线图,频数图和密度图
boxplot(e[,1]~plate)
hist(e[,1])
plot(density(e[,1]))

4.使用ggplot2对三种图进行再绘制

library(ggplot2)
colnames(e)
ggplot(e,aes(x=plate,y=MBytes))+geom_boxplot()
ggplot(e,aes(x=MBytes))+geom_histogram()
ggplot(e,aes(x=MBytes))+geom_density()

原文链接:http://www.bio-info-trainee.com/3793.html

相关文章

  • [R语言练习题]R语言初级测试题

    在学习R的过程中发现,光看书是不行的,看书仅仅停留在理解这个过程,但是我们的最终目的是灵活运用,每天感觉仿佛是看了...

  • 2019-04-19

    R语言初级练习题-上 生信技能树线下培训课,R语言初级练习题作答记录 1.PNG 根据返回结果打开电脑目录,可以看...

  • R作业初级

    初级题目 R语言练习题-初级 正式开始我们的旅程 软件安装以及R包安装参考:http://www.bio-info...

  • 2019-04-13【R语言练习题-初级】作业(ing)

    R语言练习题-初级http://www.bio-info-trainee.com/3793.html 1.打开 R...

  • R语言小作业-中级

    首先需要完成R语言练习题-初级,在[link]http://www.bio-info-trainee.com/37...

  • 盘一盘 生信技能树R语言小作业(中级)

    首先需要完成R语言练习题-初级,在http://www.bio-info-trainee.com/3793.htm...

  • R语言小作业-中级

    首先需要完成R语言练习题-初级,在http://www.bio-info-trainee.com/3793.htm...

  • R语言练习题-初级

    R语言基础知识的一些检验,最好是对照几本R基础语法书籍来理解。 全部答案及视频在:[link]https://gi...

  • R语言练习题-初级

    原帖链接: 生信菜鸟团[http://www.bio-info-trainee.com/3793.html] R语...

  • R语言初级练习题

    Q1:工作目录 Q2:新建6个向量,基于不同的原子类型(重点是字符串,数值,逻辑值) Q3:新建数据结构(矩阵,数...

网友评论

    本文标题:[R语言练习题]R语言初级测试题

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/clovqhtx.html