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Kruskal wallis检验

Kruskal wallis检验

作者: spssau | 来源:发表于2023-08-10 13:33 被阅读0次

    一、案例介绍

    在一项动物实验中,研究者欲研究A、B两种菌对小鼠巨噬细胞吞噬功能的激活作用,将59只小鼠随机分为三组,其中一组为生理盐水对照组,用常规巨噬细胞吞噬细胞吞噬功能的检测方法。试比较不同实验条件下小鼠巨噬细胞的吞噬率有无差别?如果有差别具体进行分析下。

    二、问题分析

    想要比较不同实验条件下小鼠巨噬细胞的吞噬率有无差别,可以考虑使用差异性检验,由于共有小鼠三组,所以可以使用Kruskal wallis检验进行分析如果有差异使用事后多重比较进一步分析。

    三、软件操作及结果解读

    (一) 数据导入

    1.数据格式

    首先将数据整理成正确的格式,一般X一列,Y为一例,并且分析的数据带有数据标签的,需要另添加一个表格进行说明,数据格式如下:

    2.导入数据

    将整理好的数据上传至SPSSAU系统内,如下:

    上传结果如下:

    (二) Kruskal wallis分析

    1. 软件操作

    Kruskal wallis检验属于非参数检验,分析路径为点击【通用方法】→【非参数检验】然后进行分析:

    2. 结果解读

    从上表可以得出,三组的吞噬率统计量H值为32.807,p值小于0.05.所以具有显著性差异。Kruskal wallis检验的统计量计算过程如下:

    式中,R_i^2为各组的秩和,n_i为各组对应的例数,N=sum n_{i},本例的数据具体计算过程如下:

    其中样本共有59个,所以计算如下:

    由于相同秩次较多,所以统计量需要进行校正。

    式中,m为结集的数量,T_{i}= t_{i}^3- t_{i}。

    既然模型显著,进行进一步分析每两组之间是否存在差异?使用Nemenyi方法进行分析,分析结果如下:

    C=1-rac{(2^{3}-2)}{8*(4^{3}-4)}=0.9875

    从结果可以看出,A菌组和B菌组p值为0.955>0.05,所以A菌组和B菌组之间并没有显著性差异,但是A菌组和对照组的p值远小于0.05,所以A菌组和对照组具有显著性差异,B菌组和对照组也同理。

    四、结论

    利用Kruskal wallis检验发现三组的吞噬率统计量H值为32.807,p值小于0.05.所以具有显著性差异。进一步分析,使用Nemenyi方法,发现A菌组和B菌组没有显著性差异,但是A菌组和对照组、B菌组和对照组均具有显著性差异。

    五、知识小贴士

    1、关于多重比较问题?

    如果进行非参数检验Kruskal-Wallis时发现呈现出显著性,因而可考虑继续对比两两组别之间的差异性,选中“Nemenyi两两比较”即可输出【具体这里的多重比较为Nemenyi方法多重比较】;如果Kruskal-Wallis检验显示没有差异性,则不需要进行两两比较

    2Nemenyi法和Dunn t检验如何进行选择?

    在非参数检验Kruskal-Wallis后,如果共有K个组别,需要进行事后多重比较,如果有明确的实验组,即希望使用实验组与其它组别分别进行两两比较(比较次数为K-1),此时使用Dunn t检验较为适合,与此同时,也可使用Dunn t检验校正p 值,其是在Dunn t检验基础上使用bonferroni法对p 值进行校正。如果仅仅是两两组别之间任意的比较,那么使用Nemenyi法较为适合。

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