JavaSE（java基础）程序可以打包成Jar包（J其实可以理解为Java了），而JavaWeb程序可以打包成war包（w其实可以理解为Web了）。然后把war发布到Tomcat的webapps目录下，Tomcat会在启动时自动解压war包。
JAR（Java Achive，Java归档文件）是与平台无关的文件格式，它允许将许多文件组合成一个压缩文件。为J2EE应用程序创建的JAR文件是EAR文件（企业JAR文件）。
JAR文件格式以流行的ZIP文件格式为基础。与ZIP文件不同的是，JAR文件不仅用于压缩和发布，而且还用于部署和封装库、组件和插件程序，并可被像编译器和JVM这样的工具直接使用。在JAR中包含特殊的文件，如manifests和部署描述符，用来指示工具如何处理特定的JAR。
如果一个Web应用程序的目录和文件非常多，那么将这个Web应用程序部署到另一台机器上，就不是很方便了，我们可以将Web应用程序打包成Web归档（WAR）文件，这个过程和把Java类文件打包成JAR文件的过程类似。利用WAR文件，可以把Servlet类文件和相关的资源集中在一起进行发布。在这个过程中，Web应用程序就不是按照目录层次结构来进行部署了，而是把WAR文件作为部署单元来使用。
一个WAR文件就是一个Web应用程序，建立WAR文件，就是把整个Web应用程序（不包括Web应用程序层次结构的根目录）压缩起来，指定一个.war扩展名。
区别
WAR文件和JAR文件是有根本区别的。JAR文件的目的是把类和相关的资源封装到压缩的归档文件中，而对于WAR文件来说，一个WAR文件代表了一个Web应用程序，它可以包含Servlet、HTME页面、Java类、图像文件，以及组成Web应用程序的其他资源，而不仅仅是类的归档文件。
在开发阶段不适合使用WAR文件，因为在开发阶段，经常需要添加或删除Web应用程序的内容，更新Servlet类文件，而每一次改动后，重新建立WAR文件将是一件浪费时间的事情。在产品发布阶段，使用WAR文件是比较合适的，因为在这个时候，几乎不需要再做什么改动了。
总结：war包首先是web应用项目包，里面包括的内容广泛，项目中有啥，war包中就有啥，当项目完成后，我们需要部署的时候才打war包；而jar包中包括编译后的class和部署文件，通常是对共有类方法的封装。
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