MEGA是Molecular Evolutionary Genetics Analysis即“分子进化遗传分析”的简写，这里要对3条16S序列进行序列对齐，相似计算，和绘制进化树。
1 下载，安装
官网：https://megasoftware.net/，下载，
采用win人性化（傻瓜）安装法即可。
2 合并需要比对的多条16S序列的fasta文件到一个fasta文件
3 读取并比对序列
File > Open A File > 选取 > Align
4 保存比对结果到meg文件
Data > Export Alignment > MEGA Format > 等等
5 计算序列相似矩阵
6 绘制进化树
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本文标题：MEGA序列对齐，建树
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