前言

MEGA是Molecular Evolutionary Genetics Analysis即“分子进化遗传分析”的简写，这里要对3条16S序列进行序列对齐，相似计算，和绘制进化树。

1 下载，安装

官网：https://megasoftware.net/，下载，

采用win人性化（傻瓜）安装法即可。

2 合并需要比对的多条16S序列的fasta文件到一个fasta文件

3 读取并比对序列

File > Open A File > 选取 > Align

4 保存比对结果到meg文件

Data > Export Alignment > MEGA Format > 等等

5 计算序列相似矩阵

6 绘制进化树

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