功能1:序列编辑
- 首先,要讲一条使用mega打开序列文件的技巧:直接将要分析的文件拖到mega软件的图标上,然后就是下面这个界面了。
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/d926b4b40e6f35e5.png)
- 在第一列选中序列名称,就可以对序列名称进行编辑,剪切和删除的修改。
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/cded3319d79f9898.png)
- 此外,点击Species/Abbrv,可以对序列按名称顺序进行排列,非常方便。
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/eda536310b1a0567.png)
功能2:序列比对
- 点击顶部功能栏的Alignment,一般选择下面的第一个,cluster w,也可以直接选择顶部一个大写 W 的快捷键,进行序列比对。
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/405d5715127ad888.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/f47fbf18d9e3d555.png)
- 接下来,软件会提示,没有序列被选中,是否选择所有序列,点击ok选择所有序列进行比对。
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/36207430d57711f7.png)
-
接下来,会弹出一个参数设置的界面,我们一般不做修改,直接点击ok,进行下一步。
image.png
- 之后,会出现下面这个界面,显示序列比对的进度。
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/0669ac4001bcf65f.png)
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/07dc7f168ef288b5.png)
- 序列比对完成以后,我们可以通鼠标过拖动序列顶部来选中不同的列,进行删除,以达到截齐比对结果两端的目的(非必需步骤),大致就是这样。关于构建进化树的功能将在后面讲到。
![](https://img.haomeiwen.com/i20076478/96eb0186848a5ba5.png)
https://max.book118.com/html/2018/1101/6123030034001225.shtm
https://www.renrendoc.com/paper/99854631.html
https://jingyan.baidu.com/article/358570f6a48ce5ce4724fcf2.html
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