一、为什么要安装虚拟机？
1、因为生信软件需要Linux系统；而常见PC机都是Windows或iOS
2、 系统虚拟机： VirtualBox, Vmware
程序虚拟机：Java虚拟机（JVM）
操作系统层虚拟化：Docker
3、学习生物软件
二、使用虚拟机
1、安装Virtualbox：Virtualbox中安装Linux (Ubuntu)
2、虚拟机与外界的交互:（1）远程登陆：MobaXterm； putty
（2）文件传递：WinSCP；共享文件夹
（3）剪切板、拖动
（4） Internet
三、使用linux基本用法
1、安装Linux系统
由于Linux的开源性，我们可以有很多选择，常见的有Ubuntu,centos,Fedora, Debian ,RedhatEnterpriseLinux ,SUSE OpenSUSE,Mindriva, Gentoo, Arch , Slackware等等这些主流发行版几乎占据了大多份额。这里我选择的是Ubuntu16.04
2、预装软件
安装软件有三种方法：
（1）apt-get方法
（2）dpkg安装deb包
dpkg -i package.deb
（3）make install源代码安装
3、使用技巧
在Linux下我们最常见的就是在终端进行一些操作，打开终端的方式有很多种，鼠标右键选择打开终端，或者快捷键Ctrl+Alt+T，接下来介绍一下Linux常用的命令：
（1）查看目录：ls用于查看当前路径下所有文件信息
（2）创建目录：mkdir 创建文件夹
（3）切换目录：cd 切换到指定文件
（4）复制文件、目录：cp(源文件)（目标件）
cp-r 可以指定拷贝指定的任意目录（包括子目录和文件）
cp- f 删除已经存在的目标文件而不提示。
cp- i 和f选项相反，在覆盖目标文件之前将给出提示要求用户确认。回答y时目标文件将被覆盖，是交互式拷贝。
（5）删除文件、目录:rm (文件或目录)
rm-rf可以指定删除任意的目录或文件，慎用。
rmdir删除空文件夹
（6）重命名文件、目录 mv(文件或目录名)（新名字）
（7）简单的编辑器vi
进入编辑器vi编辑，进行编辑
1) 命令行模式
控制屏幕光标的移动，字符、字或行的删除，移动复制某区段及进入Insert mode下，
或者到 last line mode。
2) 插入模式
只有在Insert mode下，才可以做文字输入，按「ESC」键可回到命令行模式。
3) 底行模式
将文件保存或退出vi，也可以设置编辑环境，如寻找字符串、列出行号……等。
编辑完之后Esc，：wq保存
（8）读取命令cat
cat有两种用法，一是将文件内容全部显示在屏幕上 cattemp.py
二是将一个文件内容放到另一个文件内，相当于cp命令 cattemp.py temp1.py
注：
关于Linux下的权限不够问题，我们在命令前面加上sudo即可。
针对切换命令cd,有一些默认小命令 cd/ 表示进入根目录 ;cd或cd~进入用户home目录;cd-表示进入上一次访问的目录，相当于back；cd .. 进入上级目录
pwd结果显示当前目录或者ctrl+l可以快速查看路径
ifconfig显示系统的网络IP信息
man显示某个命令的manual（指南）
dpkg -l可以查看电脑上安装的软件信息
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