1、配pcr体系(1+0.3+0.3+10+8.4=20):
CDE+阴性对照;K7TF2八个样+阳性、阴性对照;BAK1(CEBAK1四个样+NEBAK1九个样)13个样+阳性、阴性对照;GRF3(CEGRF3四个样+NEGRF3二十二个样)26个样+阳性、阴性对照;221-TOC1二十二个样+阳性、阴性对照。
2、跑pcr
加完模板后,第一步要用机器摇匀!(今天下午做的pcr忘记了,警告)然后预变性94℃5分钟;变性94℃30s,退火55℃30s,延伸72℃2min,33个循环;终延伸72℃5min(根据模板长度按照1kb/min设置);20℃3min。
3、制胶
戴乙腈手套,放透明板,放制胶梳,每50孔(满板)60mL计,称取的琼脂糖按照1%计,微波炉加热至澄清为止。加微量溴化乙锭(EB)出现红色即可,倒板。
4、跑胶
排枪点5微升的样,点2501红盖Marker,设置电流电压200,确认正负极(黑负红正),然后启动,跑15分钟停即可。
5、紫外显影照相
启动电脑程序,透射紫外,其他参数设置清晰后,照片保存至F盘悦姐文件夹。
6、Problem:结果不乐观。阳性对照条带很弱,有的根本就没有跑出条带!大部分样的条带都很弱!
再次“重做”!这次怀疑可能是引物的原因,换新的引物,直接用悦姐提取的DNA来做。(悦姐的板用保鲜膜封好了,要在超净工作台打开,我又忘记了!)
新引物处理方法:先离心,后根据参数×100确定加入水的量,开一个小口加入,后轻弹混匀即可。
7、其他工作:跑蛋白
原理见生物化学课本57页或链接https://m.baidu.com/sf_edu_wenku/view/9a5f35fddc3383c4bb4cf7ec4afe04a1b071b0c0原理
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