R语言配色

RColorBrewer包

分为三种类型:
1.连续型调色板: 适用于从低到高（渐变）的有序数据。

连续型调色板

2.离散型调色板: 同时强调中端临界值和数据范围两端的极端值。

离散型调色板

3.定性调色板: 适用于名义型或分类型变量。 它们并不代表组之间的大小差异。

定性调色板

绘图应用
需要注意的是RColorBrewer最少一次产生三种颜色，所以对于只需要两种颜色的作图，使用这个包的时候会报错

# 通过指定名字来查看调色板
display.brewer.pal(n = 8, name = 'RdBu')

RdBu

# RColorBrewer绘制条形图
barplot(c(2,5,7), col=brewer.pal(n = 3, name = "RdBu"))

Screenshot 2020-04-25 at 2.14.49 PM.png

Wes Anderson包

BiocManager::install("wesanderson")
library(wesanderson)
# See all palettes
names(wes_palettes)
[1] "BottleRocket1"  "BottleRocket2"  "Rushmore1"      "Rushmore"       "Royal1"        
[6] "Royal2"         "Zissou1"        "Darjeeling1"    "Darjeeling2"    "Chevalier1"    
[11] "FantasticFox1"  "Moonrise1"      "Moonrise2"      "Moonrise3"      "Cavalcanti1"   
[16] "GrandBudapest1" "GrandBudapest2" "IsleofDogs1"    "IsleofDogs2" 

wesanderson

绘图应用

barplot(c(2,5,7), col = wes_palette(n=3, name="GrandBudapest1")) 

barplot.png

创建n个连续颜色的向量

可以使用函数rainbow(n), heat.colors(n), terrain.colors(n), topo.colors(n)和cm.colors(n)生成n个连续颜色的向量

#Create a vector of n contiguous colors
# Use rainbow colors
barplot(1:5, col=rainbow(5))
# Use heat.colors
barplot(1:5, col=heat.colors(5))
# Use terrain.colors
barplot(1:5, col=terrain.colors(5))
# Use topo.colors
barplot(1:5, col=topo.colors(5))
# Use cm.colors
barplot(1:5, col=cm.colors(5))

Screenshot 2020-04-25 at 2.23.48 PM.png

产生渐变颜色colorRamp()和colorRampPalette()

colorRamp()和colorRampPalette()都可用于建立颜色板。想象一下你现在有一个色板，色板上有红色，蓝色，和白色，你就可以用colorRamp()和colorRampPalette()基于这三个颜色就行调色,两者的不同在于，colorRamp() 可以指定一个小数，返回一个指定的颜色值，需要用rgb方法转换；
colorRampPalette()返回指定数量的颜色值，两个方法可以达到相同的效果：

par(mfrow = c(1, 2))
b2p1 <- colorRampPalette(c("red", "white","blue"))
b2p2 <- colorRamp(c("red", "white","blue"))
barplot(rep(1, 12), axes=F, col = b2p1(12), border = b2p1(12), 
        main = "colorRampPalette")

rgb( b2p2(seq(0, 1, length = 12)), max = 255)
barplot(rep(1, 12), axes=F,col = rgb( b2p2(seq(0, 1, length = 12)), max = 255),
        border = rgb( b2p2(seq(0, 1, length = 12)), max = 255), main = "colorRamp")

Screenshot 2020-04-25 at 2.25.35 PM.png

搬砖from：R语言配色方案: Colors in R