经过14的马拉松式的在线直播课程,我们第一期《纳米孔测序数据分析培训班》圆满落幕,通过本次培训学员们充分了解了纳米孔测序相关的问题,并且通过实际操作,能够完成数据数据分析的工作。错过第一期网络课程的,现在可以通过观看我们的在线来进行学习,购买之后可以反复观看学习。
课程介绍
本次推出的视频课程为“纳米孔测序数据分析网络培训班(第1期)”的录播内容,虽然录播内容没有了在线直播的互动性,不过依然是学习纳米孔测序非常好的学习材料。并且视频经过剪辑,去除直播时一些等待操作。每天将近两个小时,14天的直播,视频全长将近25小时,干货满满。
通过本视频课程您将学会五大主题内容:
1、深入了解nanopore测序技术;
2、掌握生物信息Linux环境;
3、病原微生物快速鉴定(含新冠病毒数据分析);
4、拼接一个“完美”的基因组;
5、利用长读长进行SV检测。
日期主题课程安排
6月 1日课程介绍课程介绍
nanopore测序技术简介
nanopore测序技术的应用
6月 2日熟悉工作环境Linux操作基础
6月 3日测序原理测序原理
不同测序平台比较
纳米孔测序的错误问题
6月 4日开始做纳米孔测序nanopore实验室分析平台搭建
6月 5日bioconda使用安装bioconda
利用bioconda管理生物软件
6月 6日软件安装纳米孔测序软件安装
6月 7日前期数据处理HDF5(FAST5)文件格式介绍
利用Guppy进行数据转换
fastq文件格式
数据质控
数据过滤
6月 8日序列比对minimap2序列比对
sam文件格式介绍
samtools处理sam/bam文件
tablet 可视化拼接结果
6月 9日病原微生物快速鉴定纯培养样品鉴定
混合样品鉴定
NCBI物种分类介绍
nt库介绍
nt库下载
blast比对
拆分nt库
构建病毒鉴定数据库
利用MEGAN进行物种鉴定
如何提高比对速度
6月10日新冠病毒数据分析利用纳米孔测序研究新冠病毒
ARTIC Network工作流
6月11日基因组拼接纳米孔测序基因组拼接原理
常用nanopore数据拼接工具
quast组装结果评估
筛选最佳拼接结果
6月12日混合拼接不同数据混合拼接
illumina测序数据拼接
Pacbio测序数据拼接
二代+三代混合拼接方案
几种拼接方案的比较
BUSCO评估
细菌完成图拼接方案
6月13日拼接完优化组装结果优化原理
利用二代测序优化结果
medaka组装结果纠错
pilon组装结果纠错
racon组装结果纠错
6月14日长片段变异检测利用纳米孔测序检测SNP
利用纳米孔测序检测SV
利用IGV可视化突变结果
如何购买
视频目前已上架腾讯课程,微信登录购买即可观看,课程原价2688元,目前上线促销,领取优惠券,只需半价1344元,优惠券数目有限,三天有效,先到先得。点击“阅读原文”领取优惠。购买之后,联系我们,将获得培训版电子版讲义以及400页培训PPT。
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