富集分析一般到最常见的是GO/KEGG富集，其思路是先筛选差异基因，然后对差异基因进行GO/KEGG注释。例如GO富集分析是先筛选差异基因，再判断差异基因在哪些注释的通路存在富集。这涉及到阈值的设定，存在一定主观性并且只能用于表达变化较大的基因，即我们定义的显著差异基因。而GSEA则不局限于差异基因，从基因集的富集角度出发，理论上更容易囊括细微但协调性的变化对生物通路的影响。
本文目标 GSEA原理等介绍 java版本的GSEA运行示例 纯R版本的GSEA运行示例 第一部分 GSEA原理...
GSEA基因集富集分析 1、用clusterProfiler做GSEA - 简书 2、GSEA-基因集富集分析 -...
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R版本较老，在分析时候遇到无法解决的报错就重新更新了R包 R软件更新 install.packages("inst...
本文标题：一文解决GSEA富集分析（jave软件版本、R语言代码版本）
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