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课程汇总
课程汇总
作者:
单细胞空间交响乐
| 来源:发表于
2024-08-28 11:51 被阅读0次
作者,Evil Genius
有人举报,不让上课,不让分享课程,不让收学员,我把内容全部汇总出来,大家如果有需要备一份,万一敌对势力强大,不得不屈服,也是没办法的事。
2024年课程从6月22号开始上第一节课,8月21号上最后一节,视频全部上传到了B站,B站名字七夜听雪ii,连接在
https://space.bilibili.com/390048230?spm_id_from=333.1007.0.0
。
没办法,视频如果举报有下架的风险。
B站从最开始的单细胞分析课程,到如今的系列多组学课程,一共70个视频。
2024年全系列课程表,略有改动,包括单细胞六课,空间22课,2节汇总课程,空间包括Visium、HD、Xenium。
第一课:单细胞联合突变信息分析
第二课:单细胞数据分析之新版 velocity
第三课:单细胞数据分析之 CNV 聚类
第四课:单细胞通讯分析大汇总(cellphoneDB、NicheNet、CellChat)
第五课:单细胞联合 VDJ分析
第六课:单细胞联合 ATAC 分析
第七课:空间转录组整合分析与形态学判定(空间注释)
第八课:单细胞空间联合分析(cell2location)与区域细胞富集
第九课:空间细胞类型共定位与细胞通路同定位
第10课:单细胞空间联合分析之 MIA
第 11 课:空间生态位通讯与 COMMOT
第 12 课:空间转录组之分子 niche 与细胞 niche
第 13 课:空间网络(基因、细胞、通路网络)
第14课:空间转录组微生物的检测运用
第 15 课:空间 VDJ(暂定)
第 16 课:空间 CNV burden 与 CNV 聚类
第 17 课:空间邻域分析(banksy、CellNeighborEx),分子邻域与细胞邻域
第 18 课:空间转录组 hotspot
第 19 课:空间细胞“社区”(空间细胞“unit”)
第20课:空间基因梯度
第21课:空间转录组的活性空间域
第 22 课:空间转录组之 velocity
第 23 课:空间轨迹
第24课:细胞邻域特征评分(异型细胞网络)
第25课:空间分子生态位差异分析
第 26 课:高精度 HD 平台数据分析框架
第 27 课:高精度 HD 平台分析内容与 niche
第 28 课:Xenium 分析框架
第29 课:原位数据细胞分割导论
第 30 课:Xenium 生态位分析与微环境分析
2023年全系列空间课程表,也略有改动。
空间基础处理(Seurat)
空间多样本联合分析(Seurat)
空间基础处理(scanpy)
单细胞空间联合分析(Seurat)
单细胞空间联合分析(cell2location)
单细胞空间联合分析(RCTD)
单细胞空间联合分析(MIA)
空间转录组通讯分析(stlearn)
空间转录组通讯分析(COMMOT)
空间转录组轨迹分析(SPATA2)
空间转录组CNV分析(SPATA2、siCNV)
空间转录组富集分析(GSVA、包括marker的富集打分)
空间转录组高级绘图(细胞共定位、饼图、空间密度图)
空间转录组高级绘图(细胞类型方向图、区域细胞密度气泡图)
空间转录组绘图(配受体空间分布、配受体共定位、细胞定位近邻热图)
空间转录组细胞聚类
空间转录组细胞共定位
空间转录组细胞网络(cell degree)
空间轨迹(SPATA2)
空间基因开关
空间轨迹向量场
空间文章复现
还有很多单细胞的课程
生活很好,有你更好
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课程汇总
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