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hpc用户无admin权限安装的软件总结

hpc用户无admin权限安装的软件总结

作者: SnorkelingFan凡潜 | 来源:发表于2021-06-09 12:45 被阅读0次

    一 有时候hpc无权限 不能编译 所以有直接安装使用的二进制软件会很方便

    1. canu
      https://github.com/marbl/canu/releases
    To install from a binary distribution (recommended):
    
    tar -xJf canu-2.1.1.*.tar.xz
    
    • Detected Java(TM) Runtime Environment '1.7.9_221'不满足程序所需Java SE 8的要求时,需自行下载Java SE 8export.bashrc
      export PATH=/home/users/00.bin/jre1.8.0_291/bin/:$PATH #注意是到bin就可不要写到java否则还是系统默认的java版本优先

    二 用conda安装

    install a conda package also without activating the environment. 
    Just use conda install -n <env_name> <package> or conda install -p <path/to/env> <package>
    
    #for example
    conda install -p /home/users/myname/00.bin/ -c conda-forge -c bioconda quickmerge
    

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