向NCBI上传SRA数据

作者: dashan1928 | 来源:发表于2021-12-13 13:35 被阅读0次

1.将数据名称改为提交的数据表中的名称

2.下载aspera软件

wget https://download.asperasoft.com/download/sw/connect/3.8.1/ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz

tar xf ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.tar.gz

./ibm-aspera-connect-3.8.1.161274-linux-g2.12-64.sh #该脚本只能非root用户执行安装

3.下载自己专属的keyfile，上传的服务器

4.ascp -i <pathtokeyfile> -QT -l100m -k1 -d <pathtoyourdatafile> subasp@upload.ncbi.nlm.nih.gov:uploads/zhongzhaoshan_163.com_CdPmCltB

5.上传速度约30mb/s

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