vConTACT2 | Error in identifyin

最近，跑vConTACT2[1]，对比各种宏病毒数据集。
几天过去了，分析已经差不多接近尾声。
然而，出现了报错，如下：

ERROR:vcontact2: Error in identifying excluded genomes (i.e. those dropped for being singletons or outliers): [Errno 2] No such file or directory: '/Users/bolduc.10/Downloads/merged_df_alterntaive.csv'

百度了几下，毛都没搜到。
最终还是Google比较好使，
瞬间找到“Asier Zaragoza Solas”大佬给出的建议[2]。

根据大佬的建议，解决方法如下：
首先，用vim打开summaries.py文件进行编辑。

vi ~/miniconda3/envs/vContact2/lib/python3.8/site-packages/vcontact2/exports/summaries.py

找到下面这行：

merged_df.to_csv('/Users/bolduc.10/Downloads/merged_df_alterntaive.csv')

将单引号中的目录改为本机中存在的目录。

merged_df.to_csv('~/merged_df_alterntaive.csv')

就酱！！！

参考文献

[1] https://bitbucket.org/MAVERICLab/vcontact2/wiki/Home
[2] https://bitbucket.org/MAVERICLab/vcontact2/issues/57/error-in-identifying-excluded-genomes