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学习小组Day6笔记--monocyte

学习小组Day6笔记--monocyte

作者: monocyte宇坤 | 来源:发表于2020-04-30 22:15 被阅读0次

    加载镜像及

    1. 安装加载三部曲
    options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))  #加CRAN载镜像,对应清华源
    options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")  #加Bioconductor载镜像,对应中科大源
    install.packages("dplyr") #安装dplyr
    library(dplyr) #加载dplyr
    
    1. 示例数据
      test <- iris[c(1:2,51:52,101:102),]
      示例数据为内置数据集iris的简化版,ji第1,2,51,52,101,102行的数据赋值test

    dplyr五个基础函数

    1. mutate(),新增列
      mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width) # mutate(文件, 列名 = 数据)

    2. select(),按列号/列名筛选
      select(test,列号/列名)

    3. filter()筛选行

    4. arrange(),按某1列或某几列对整个表格进行排序
      arrange(test, Sepal.Length)#默认从小到大排序 arrange(test, desc(Sepal.Length))#desc:降序排列

    5. summarise():汇总

    summarise(test,mean(Sepal.Length),sd(Sepal.Width))
    #分别计算test变量中Sepal.Length和Sepal.Width列的平均值和方差
    group_by(test,species) 
    #对于test变量中的species列进行分组,相同的放在一起
    summarise(group_by(test,Species),mean(Sepal.Length),sd(Sepal.Width))
    #分别计算test变量不同物种中Sepal.Length和Sepal.Width列的平均值和方差
    

    dplyr两个实用技能

    1. 管道操作 %>% (cmd/ctr + shift + M)

    加载任意一个tidyverse包即可用管道符号

    作用?把数据加载到%>%后面的的条件中?

    1. count统计某列的unique值
      count(数据,列名) #统计Species的种类以及数量

    dplyr处理关系数据

    即将2个表进行连接,注意:不要引入factor

    options(stringsAsFactors = F) # options 设置环境;stringsAsFactors = F # 不要引入factor
    test1 <- data.frame(x = c('b','e','f','x'), 
                        z = c("A","B","C",'D'),
                        stringsAsFactors = F)
    

    1.內连inner_join,取交集
    inner_join(test1, test2, by = "x")
    2.左连left_join
    left_join(test1, test2, by = 'x')
    3.全连full_join
    full_join( test1, test2, by = 'x')
    4.半连接:返回能够与y表匹配的x表所有记录semi_join
    semi_join(x = test1, y = test2, by = 'x')
    5.反连接:返回无法与y表匹配的x表的所记录anti_join
    anti_join(x = test2, y = test1, by = 'x')
    6.简单合并
    bind_rows(test1, test2) #行合并,需要两个表格列数相同 bind_cols(test1, test3) #列合并,需要有相同的行数
    相当于base包里的cbind()函数和rbind()函数

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