美文网首页数据库
2022-01-17 单细胞数据库

2022-01-17 单细胞数据库

作者: 徐添添 | 来源:发表于2022-01-17 11:04 被阅读0次

1GEO

image.png
image.png
image.png
直接发邮件要数据
image.png
10×数据提取3个文件或者一个表达矩阵

image.png

2EBI

image.png
image.png
image.png
image.png

点download


image.png
可以参考相同研究的marker基因用来注释;
一般下载raw数据,不要标准化的数据

3胖老大宝数据库

image.png
image.png

protocal筛选测序方法,点样本旁边的view,可以直接下载R.data


基因检索功能

image.png
image.png
image.png
marker基因检索功能
image.png
文献知识库
image.png
胖老大宝总结
image.png

4HCA用来找对照样本

image.png

5scRNASeqDB


image.png

检索基因在不同细胞中的表达水平


image.png
检索细胞
image.png

6BIsc

image.png

7cellmarker数据库用来注释细胞

image.png
image.png

数据库总结

image.png

数据检索:HCA用来找对照,scRNAseqDB可以检索细胞类型
数据分析:panglaoDB有分析最新分析方法的文献
研究基础:看别人是怎么设计课题,panglaoDB可以检索单基因,Broad institute有很多新研究的数据
细胞注释:首选cellmarker,HCL是一个比较新的marker数据库

其他

image.png image.png

相关文章

网友评论

    本文标题:2022-01-17 单细胞数据库

    本文链接:https://www.haomeiwen.com/subject/dzhchrtx.html