RNA-seq 数据检测融合基因，在 tophat-fusion 这一步报错：
./SeqAn-1.4.2/seqan/basic/basic_exception.h:236 FAILED! (Uncaught exception of type St12out_of_range: basic_string::substr)
第一次运行的是 tophat 报这个错，然后换用 tophat2 重新运行，还是报这个错。
google 之后发现 biostar 有人给出了解决办法，很简单，用tophat2.1.0这个版本就好了！我检查了一下自己的 tophat2 是 2.1.1 的，重新下载 tophat2.1.0 然后安装重跑，浪费了我半天时间的 bug 就解决了。
为什么 tophat1 和 tophat2.1.1 都在这里出问题，而唯独 tophat2.1.0 顺利跑完了……
作者：wangpeng905
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tophat2和cufflinks安装 http://blog.sina.com.cn/s/blog_751bd9...
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tophat2{官网下载} 首先安装好bowtie2 下载地址：http://sourceforge.net/pr...
市面上公司做RNA-Seq的一般流程是： tophat2 ---> Cufflinks ---> Cuffdiff...
author:风吹过的94data:2016-051.QC2.比对(tophat2) 3.组装(cufflinks...
2.软件以及流程以及代码： 本实验使用常规的Tophat2 比对 （1）样本制备、建库：总RNA ---> pol...
###因为gtf和fastq的对应关系，从igenome上打包下载所有hg19的信息## 1. tophat2比对...
error itms-90087 error itms-90209 error itms-90125 error ...
本文标题：Tophat2 error
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