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python完整实现逻辑回归

python完整实现逻辑回归

作者: YCzhao | 来源:发表于2018-11-13 19:14 被阅读0次
  1. 数据
    我们将建立一个逻辑回归模型来预测一个学生是否被大学录取。假设你是一个大学系的管理员,你想根据两次考试的结果来决定每个申请人的录取机会。你有以前的申请人的历史数据,你可以用它作为逻辑回归的训练集。对于每一个培训例子,你有两个考试的申请人的分数和录取决定。为了做到这一点,我们将建立一个分类模型,根据考试成绩估计入学概率。

  2. 导入数据并查看

import numpy as np
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
%matplotlib inline
import os
path = 'data' + os.sep + 'LogiReg_data.txt' # os.sep 根据你所处的平台,自动地采用相应的分割符号。
pdData = pd.read_csv(path, header=None, names=['Exam 1', 'Exam 2', 'Admitted'])
pdData.head()
前5条数据
pdData.shape
数据量100行3列
positive = pdData[pdData['Admitted'] == 1] # 指定正例
negative = pdData[pdData['Admitted'] == 0] # 指定负例

fig, ax = plt.subplots(figsize=(10,5))
ax.scatter(positive['Exam 1'], positive['Exam 2'], s=30, c='b', marker='o', label='Admitted')
ax.scatter(negative['Exam 1'], negative['Exam 2'], s=30, c='r', marker='x', label='Not Admitted')
ax.legend()
ax.set_xlabel('Exam 1 Score')
ax.set_ylabel('Exam 2 Score')
数据分布情况
  1. 使用逻辑回归


    算法实现步骤
  2. 先来建立sigmoid函数


def sigmoid(z):
    return 1 / (1 + np.exp(-z))
nums = np.arange(-10, 10, step=1) 
fig, ax = plt.subplots(figsize=(12,4))
ax.plot(nums, sigmoid(nums), 'r')
sigmoid
  1. model 返回预测结果
def model(X, theta): # 预测函数
    
    return sigmoid(np.dot(X, theta.T)) # 矩阵的乘法
需要设置的权重参数
pdData.insert(0, 'Ones', 1) # 新增一列值都为1
# set X (training data) and y (target variable)
orig_data = pdData.as_matrix() 
cols = orig_data.shape[1]
X = orig_data[:,0:cols-1]
y = orig_data[:,cols-1:cols]

# 转换成numpy数组并插入参数数组
#X = np.matrix(X.values)
#y = np.matrix(data.iloc[:,3:4].values) #np.array(y.values)
theta = np.zeros([1, 3]) # 设置三个theta值

查看一下设置后的效果

X[:5]
y[:5]
theta
X.shape, y.shape, theta.shape

6 . 构造损失函数, 计算平均损失


def cost(X, y, theta):
    left = np.multiply(-y, np.log(model(X, theta)))
    right = np.multiply(1 - y, np.log(1 - model(X, theta)))
    return np.sum(left - right) / (len(X))
cost(X, y, theta) # 平均损失值
平均损失值
  1. 计算梯度


    求theta偏导
def gradient(X, y, theta):
    grad = np.zeros(theta.shape) # 有几个theta就有几个梯度
    error = (model(X, theta)- y).ravel()
    for j in range(len(theta.ravel())): #for each parmeter
        term = np.multiply(error, X[:,j])
        grad[0, j] = np.sum(term) / len(X)
    
    return grad

比较3种不同的梯度下降方法

STOP_ITER = 0
STOP_COST = 1
STOP_GRAD = 2

def stopCriterion(type, value, threshold):
    #设定三种不同的停止策略
    if type == STOP_ITER:        return value > threshold
    elif type == STOP_COST:      return abs(value[-1]-value[-2]) < threshold
    elif type == STOP_GRAD:      return np.linalg.norm(value) < threshold
import numpy.random
# 为了使模型的泛化能力更强, 将数据全部打乱
def shuffleData(data):
    np.random.shuffle(data) # 洗牌函数
    cols = data.shape[1]
    X = data[:, 0:cols-1]
    y = data[:, cols-1:]
    return X, y
# 观察时间对结果的影响
import time

def descent(data, theta, batchSize, stopType, thresh, alpha):
    #梯度下降求解
    
    init_time = time.time()
    i = 0 # 迭代次数
    k = 0 # batch
    X, y = shuffleData(data)
    grad = np.zeros(theta.shape) # 计算的梯度
    costs = [cost(X, y, theta)] # 损失值

    
    while True:
        grad = gradient(X[k:k+batchSize], y[k:k+batchSize], theta)
        k += batchSize #取batch数量个数据
        if k >= n: 
            k = 0 
            X, y = shuffleData(data) #重新洗牌
        theta = theta - alpha*grad # 参数更新
        costs.append(cost(X, y, theta)) # 计算新的损失
        i += 1 
        
        # 何时停止
        if stopType == STOP_ITER:       value = i
        elif stopType == STOP_COST:     value = costs
        elif stopType == STOP_GRAD:     value = grad
        if stopCriterion(stopType, value, thresh): break
    
    return theta, i-1, costs, grad, time.time() - init_time
#  根据传入参数选择梯度下降方式以及停止策略并绘图展示
def runExpe(data, theta, batchSize, stopType, thresh, alpha):
    #import pdb; pdb.set_trace();
    theta, iter, costs, grad, dur = descent(data, theta, batchSize, stopType, thresh, alpha)
    name = "Original" if (data[:,1]>2).sum() > 1 else "Scaled"
    name += " data - learning rate: {} - ".format(alpha)
    if batchSize==n: strDescType = "Gradient"
    elif batchSize==1:  strDescType = "Stochastic"
    else: strDescType = "Mini-batch ({})".format(batchSize)
    name += strDescType + " descent - Stop: "
    if stopType == STOP_ITER: strStop = "{} iterations".format(thresh)
    elif stopType == STOP_COST: strStop = "costs change < {}".format(thresh)
    else: strStop = "gradient norm < {}".format(thresh)
    name += strStop
    print ("***{}\nTheta: {} - Iter: {} - Last cost: {:03.2f} - Duration: {:03.2f}s".format(
        name, theta, iter, costs[-1], dur))
    fig, ax = plt.subplots(figsize=(12,4))
    ax.plot(np.arange(len(costs)), costs, 'r')
    ax.set_xlabel('Iterations')
    ax.set_ylabel('Cost')
    ax.set_title(name.upper() + ' - Error vs. Iteration')
    return theta
  1. 比较不同的停止策略
  • 基于迭代次数停止
#选择的梯度下降方法是基于所有样本的
n=100
runExpe(orig_data, theta, n, STOP_ITER, thresh=5000, alpha=0.000001) # 迭代次数5000, 学习率0.0000001
基于迭代次数停止
  • 基于指定损失值停止
    设定阈值 1E-6, 差不多需要110 000次迭代
runExpe(orig_data, theta, n, STOP_COST, thresh=0.000001, alpha=0.001)
基于指定损失值停止
  • 基于梯度变化停止
    设定阈值 0.05,差不多需要40 000次迭代
runExpe(orig_data, theta, n, STOP_GRAD, thresh=0.05, alpha=0.001)
基于梯度变化停止
  1. 对比不同的梯度下降法
  • 随机梯度下降法Stochastic descent
runExpe(orig_data, theta, 1, STOP_ITER, thresh=5000, alpha=0.001) # 每次迭代1个样本

显然很不稳定, 试试将学习率调小一些

runExpe(orig_data, theta, 1, STOP_ITER, thresh=15000, alpha=0.000002)
调整学习率之后

由上图可以看出速度快,但稳定性差,需要很小的学习率

  • 小批量梯度下降法(Mini-batch Gradient Descent)
runExpe(orig_data, theta, 16, STOP_ITER, thresh=15000, alpha=0.001)

浮动仍然比较大,我们来尝试下对数据进行标准化 将数据按其属性(按列进行)减去其均值,然后除以其方差。最后得到的结果是,对每个属性/每列来说所有数据都聚集在0附近,方差值为1

from sklearn import preprocessing as pp

scaled_data = orig_data.copy()
scaled_data[:, 1:3] = pp.scale(orig_data[:, 1:3])

runExpe(scaled_data, theta, n, STOP_ITER, thresh=5000, alpha=0.001)

它好多了!原始数据,只能达到达到0.61,而我们得到了0.38个在这里! 所以对数据做预处理是非常重要的

runExpe(scaled_data, theta, n, STOP_GRAD, thresh=0.02, alpha=0.001)
更多的迭代次数会使得损失下降的更多!
theta = runExpe(scaled_data, theta, 1, STOP_GRAD, thresh=0.002/5, alpha=0.001)

随机梯度下降更快,但是我们需要迭代的次数也需要更多,所以还是用batch的比较合适!!!

  • 最终使用mini-batch, 将批量值设为16
runExpe(scaled_data, theta, 16, STOP_GRAD, thresh=0.002*2, alpha=0.001)

只迭代了4000次, 损失值为0.21 得到了相对较好的效果

  1. 精度
#设定阈值
def predict(X, theta):
    return [1 if x >= 0.5 else 0 for x in model(X, theta)]

scaled_X = scaled_data[:, :3]
y = scaled_data[:, 3]
predictions = predict(scaled_X, theta)
correct = [1 if ((a == 1 and b == 1) or (a == 0 and b == 0)) else 0 for (a, b) in zip(predictions, y)]
accuracy = (sum(map(int, correct)) % len(correct))
print ('accuracy = {0}%'.format(accuracy))
转换为概率值

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