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20201118-融合基因

20201118-融合基因

作者: 野山羊骑士 | 来源:发表于2020-11-18 13:35 被阅读0次

    关于基本概念的理解:
    https://www.cnblogs.com/aipufu/p/11615336.html
    https://www.biomart.cn/experiment/793/2714649.htm
    https://www.cnblogs.com/nkwy2012/p/6517753.html

    最大收获:

    【基于全基因组测序和转录组测序鉴定基因融合】

    基因融合的鉴定,可以基于全基因组测序数据(whole-genome sequencing,WGS),也可以利用转录组测序数据(RNA-seq),或者二种技术结合起来更好。

    全基因组测序鉴定出的基因融合,基本能确定是由于基因组层面发生某种变异而引起的,但如果没有转录组测序数据,就无法准确判断融合后产生的新基因是否能够表达,或表达量的高低。

    而转录组测序数据鉴定出的基因融合,可以明确是能表达的基因融合,但却无法完全确定是否是由基因组变异产生的,还是来源于两个不同基因转录后发生的RNA融合。

    因此,如果条件允许,同时结合全基因组测序和转录组测序来鉴定基因融合,能够获得更准确的鉴定结果。

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