免疫分析在肿瘤中一直是非常hot的“热点”,围绕免疫又出现了一波热潮,如免疫分型、免疫相关lncRNA等,今天在看文献时,发现又出现了新的热点免疫相关eRNA。下面就来分析下这篇文章。
知识点
- eRNAs: Enhancer RNAs,增强子RNA。增强子是一类DNA调节序列,可以激活基因表达而不依赖于它们与其靶基因的距离或方向。eRNA的长度为0.5-5kb,因此可以分类为lncRNA,可以通过靶向tumor-related genes和immune checkpoints参与恶性肿瘤的进展。
- IRGs:immune-related genes,免疫相关基因,作者从 Molecular Signature Database v4. 0提取567个IRGs。
- IReRS:immune-related eRNAs,免疫相关eRNA。作者根据Pearson correlation coefficient > 0.4, p < 0. 001选取64个IReRS。
技术路线
结果解读
1.模型构建
Fig.12.模型验证
Fig.23.模型周边
3.1 模型周边-临床病理特征
Fig.33.2 模型周边-cox分析
Fig.43.3 模型周边-nomogram
Fig.53.4 模型周边-富集分析+免疫分析
Fig.63.模型eRNA周边
最后作者分析模型eRNAs的基因表达和预后情况。
Fig.7
体会
作者选项免疫相关的eRNAs进行模型构建,并进行模型及模型构建eRNA的周边分析,整体思路比较严谨。
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