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conda安装qiime1

conda安装qiime1

作者: R语言数据分析指南 | 来源:发表于2020-04-12 17:16 被阅读0次
    1.首先conda设置清华镜像源

    vim .condarc

    channels:
    - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
    - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
    - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
    - bioconda
    - defaults
    - r
    - https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
    - conda-forge
    show_channel_urls: true
    

    安装不成功很大一部分源于网络原因

    2.创建qiime1环境指定python版本安装
    conda create -n qiime1 python=2.7 qiime matplotlib=1.4.3 mock nose -c bioconda
    
    3. 进入qiime1环境
    source activate qiime1 #激活qiime1环境
    
    conda info --envs #看所处的环境
    

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