EBI: biomart

作者: LET149 | 来源:发表于2023-12-12 10:44 被阅读0次

分析后生动物的基因同源性，输出两个或者多个物种之间的直系同源或者旁系同源基因

http://asia.ensembl.org/biomart/martview/c52f4d523816936b6ef60911aab25faf
image.png

教程:

https://zhuanlan.zhihu.com/p/26381942

使用 biomaRt 包来提取此网站信息

https://www.jianshu.com/p/abf5138e3757
https://zhuanlan.zhihu.com/p/593447503

biomaRt物种间同源基因查询
biomaRt 是R语言访问 BioMart software suite[http://www.biomart....
BioMart在线转换ID
Emsenbl的BioMart工具： http://asia.ensembl.org/biomart/martvi...
实例讲述bioMart包的用法
bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口，能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库这个·包...
实例讲述bioMart包的用法
bioMart包是一个连接bioMart数据库的R语言接口，能通过这个软件包自由连接到bioMart数据库这个·包...
根据rs号使用biomaRt做SNP注释
参考链接：biomaRt: 用R愉快检索BioMart数据库 - 简书 (jianshu.com)[https:/...
biomart
这个包很久以前我就给它写过教程(点击阅读)，但是排版不好，可读性很差，所以我用R Markdown重新来一个。当...
关于SNP
网址：https://www.ebi.ac.uk/sites/ebi.ac.uk/files/content.eb...
R: biomaRt获取Ensembl基因组信息
导读用biomaRt获取ensembl数据库各物种基因染色体位置信息。 R包地址 biomaRt：https:/...
个人电脑上SRR数据下载
第一种，在EBI 查找，https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/home[https:...
R中安装httr出现的问题
在做RNAseq时，安装BiomaRt出现了问题，参考了biomaRt包的安装，却又在安装httr的时候发现安装不...