今天在做项目的时候遇到一个问题,给定一组点,如何方便快捷的求出点之间的距离。比如总共有100个点,两两组合求距离,总共有组距离。
如何求出这些距离呢?最先想到的是循环处理。
我们先定义距离函数:
import math
def dis_func(p1,p2):
d = math.sqrt((p1[0] - p2[0])**2 + (p1[1] - p2[1])**2)
return d
循环处理,为了避免重复以及与点本身计算距离内循环从i + 1
开始。:
distances = []
for i in range(len(points)):
distance = []
for j in range(i+1,len(points)):
d = dis_func(points[i],points[j])
distance.append(d)
distances.append(distance)
结果是一个嵌套的阶梯状的列表,不容易使用,也不容易查找距离对应的点组是哪两个。于是可以这样写:
distances = []
for i in range(len(points)):
distance = []
for j in range(len(points)):
if j <= i:
d = None
else:
d = dis_func(points[i],points[j])
distance.append(d)
distances.append(distance)
我们填入了None
作为占位符号。
最后用numpy库对嵌套列表转换:
distances = np.array(distances)
这样我们就很容易取出计算出的两个点的距离了,比如第23个点与第58个点的距离:
print(distances[22,57])
但如果点很多时由于python的运算速度所限,就不那么好用了。
3000个点距离计算时间从结果来看,当数据点有3000个点时候,运算速度就已经很慢了,平均达到了4.73秒。
解决这个问题的办法是求助于第三方库,比如
numpy
:假设目前就有3000个点,我们首先把点列表转换为
numpy
的array
,然后分别取出来x
与y
值。
points = np.array(points)
points_xvalue = points[:,0]
points_yvalue = points[:,1]
再分别求中的与。
x1,x2 = np.meshgrid(points_xvalue,points_xvalue)
square_x = (x1 - x2)**2
y1,y2 = np.meshgrid(points_yvalue,points_yvalue)
square_y = (y1 - y2)**2
最后求结果:
res = np.sqrt(square_x + square_y)
可以将以上过程整合到一个函数里面:
def dis_func_new(xy):
points_xvalue = points[:,0]
points_yvalue = points[:,1]
x1,x2 = np.meshgrid(points_xvalue,points_xvalue)
square_x = (x1 - x2)**2
y1,y2 = np.meshgrid(points_yvalue,points_yvalue)
square_y = (y1 - y2)**2
res = np.sqrt(square_x + square_y)
return res
numpy数组3000个点距离计算
时间缩短到了0.4秒。但实际上鉴于numpy的广播机制,我们的代码还可以减少,运算速度也还可以再提升。
def dis_func_new(xy):
x1,x2 = points[:,0],points[:,[0]]
y1,y2 = points[:,1],points[:,[1]]
square_x = (x1 - x2)**2
square_y = (y1 - y2)**2
res = np.sqrt(square_x + square_y)
return res
这个函数代码少去了两行,运行结果也显示,时间也只0.26秒,性能进一步提升。
可见,在大数组运算时,numpy库相比python自有的嵌套列表循环,快了还是很多的!
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