IntaRNA的使用

1、安装

#这两个命令都可（或者都输一遍）
conda install -c conda-forge -c bioconda intarna
conda install intarna

#更新一下
conda update intarna

#查看是否安装成功（注意IntaRNA大小写和安装时不一样）
IntaRNA --help

2、使用

-q 输入ncRNA序列
-t 输入mRNA序列
输入数据为FASTA格式（.gz的格式可默认解压）

### 命令
IntaRNA --threads 20  -t GCF_001605985.2_ASM160598v2_rna.fasta -q lncrna-gfold.fasta --out out.txt qMinE

### 后台运行
vim sleep.sh

# sleep.sh里添加命令
IntaRNA --threads 20  -t GCF_001605985.2_ASM160598v2_rna.fasta -q lncrna-gfold.fasta --out out.txt qMinE

# 挂后台
nohup bash sleep.sh >rizhi.log &

#查看是否运行
top -u fanzhiyu_31946012_cyl_150
ps -ef |grep "fanzhiyu_31946012_cyl_150"