这是一个bug
你得保证-r 后面ID作为primary key不在最后一项出现，
但如果在-r后批量写RG text，比如
samtools addreplacerg -r ID:xxx SM:xxx -o xxxx.bam xxxxxxx.bam
依然报这个错。
所以你得这样写：
samtools addreplacerg -r ID:xxx -r SM:xxx -o xxxx.bam xxxxxxx.bam
-r出现至少两次以上……以及ID放在第一个-r后。
这是一个bug
你得保证-r 后面ID作为primary key不在最后一项出现，
但如果在-r后批量写RG text，比如
samtools addreplacerg -r ID:xxx SM:xxx -o xxxx.bam xxxxxxx.bam
依然报这个错。
所以你得这样写：
samtools addreplacerg -r ID:xxx -r SM:xxx -o xxxx.bam xxxxxxx.bam
-r出现至少两次以上……以及ID放在第一个-r后。
这是一个bug 你得保证-r 后面ID作为primary key不在最后一项出现，但如果在-r后批量写RG tex...
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本文标题：samtools addreplacerg 报错 The sup
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