最近,来自纽约的科学家通过一项新的GWAS研究和meta分析,将6个新基因位点与多发性骨髓瘤的风险联系了起来。
在美国,每年大约有30770个新的多发性骨髓瘤病例,在这些病例中,病人发病似乎有遗传原因。此前已被报道有17个遗传位点与多发性骨髓瘤风险有关。
该结果发表在期刊《Nature Communications》上。研究人员还发现,这些位点似乎扰乱了发育中的转录调节因子。
在本研究中,科学家使用IlluminaOncoArray芯片对来自英国的878例多发性骨髓瘤病例和7083例对照组进行了GWAS测试。然后将他们的数据与其他6个多发性骨髓瘤GWAS数据集结合起来,总共收集了7 319例病例和234 385例对照病例。他们复制了在1777例病例和6088名对照组中发现的9个基因位点,最终将6个新基因位点与多发性骨髓瘤风险联系了起来。
根据他们制定的多基因风险评分,研究人员估计,23个新的和已知的多发性骨髓瘤风险位点约占疾病遗传力的16%。处于多发性骨髓瘤遗传风险前1%的人患多发性骨髓瘤的风险比有中位遗传风险的人高出大约三倍。
研究人员指出,这23个多发性骨髓瘤的危险位点倾向于落在非编码区内,影响基因调控。利用在多发性骨髓瘤细胞系上产生的ChIP-seq数据,结合B细胞表观基因组项目数据,研究人员发现在活性染色质区域以及B细胞转录因子结合位点中富集了多个骨髓瘤相关位点。他们说,这支持了这样的观点,即这些风险基因位点可能通过影响参与转录起始和增强的顺式调控网络而发挥作用。
利用捕获的Hi-C和eQTL数据,研究人员找出了这些基因位点能够工作的四种潜在机制。他们指出,四个危险基因含有与细胞周期调控和基因组不稳定性相关的候选基因。其他三个危险位点可追溯到参与染色质重塑的候选基因,而5个基因位点与凋亡或自噬有关。最后,他们将三个位点与B细胞和浆细胞的分化和功能联系起来。
为这项研究提供资金的英国骨髓瘤公司(Myeloma UK)的研究主任西蒙·里德利(Simon Ridley)在一份声明中说:“这项研究将提高我们对推动骨髓瘤发展治疗和其复杂途径的认识,有可能确定新的骨髓瘤疗法,并成为使患者能够进行治疗的关键,”
然而,研究人员警告说,他们的数据集和他们收集的数据仅包括欧洲血统的人类。他们指出,这些风险SNP对非裔美国人的影响可能不同,例如,多发性骨髓瘤的发病率很高。
参考资料:GWAS Links Six New Loci to Multiple Myeloma Risk, Uncovers Potential Mechanisms|GenomeWeb
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