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组织提RNA越来越纯了。。。(含操作流程及心得)

组织提RNA越来越纯了。。。(含操作流程及心得)

作者: 医博云天 | 来源:发表于2019-01-16 22:21 被阅读1次

    2019年1月16日,星期三,晴
    今天起床比较早,出门也比较早。跟研究所HQY老师商量了能不能再买冰箱,冰箱6能否借用等系列问题。

    跟SZM同学要的食管细胞又是没能拿到,有点遗憾!一大早他师弟LZ给我发消息说细胞状态不好,不排除污染可能,今天就没办法拿了。我赶紧联系DF同学,让她不用过去了。

    去了中心实验室,把细胞培养专用箱整理了一下。由于早上乳腺科处理血清,占用4℃离心机,也就没办法提组织RNA了。又因为我预约超净台的时间是14:30-17:30,所以也没办法处理细胞。(在此感谢厦门师弟WZG,一大早还打电话关心细胞的生长状态)

    师弟HY和YXH相继来实验室找我,一个是来探讨毕业论文的事宜,一个是来探望我。

    泌尿外科ZB,早上准备进行q-PCR上机,需要我协助他上机操作。我这就凭借自己的三脚猫功夫勉强指导了一下。可是他进行的是miRNA,和一般的mRNA在方法上不大一样,机器一直报故障,请中心实验室的老师来指导,结果也不行,最后还是产家协助搞定。

    在此间隙,我再次提取了组织RNA,这次比昨天那次更流畅了,提出来RNA的浓度是800,纯度1.86。(不放心,又去超微量分光光度仪上测了一把,浓度也是800,纯度是1.88,但还是出现了三角形标志,提示RNA不够纯,查看原因是胍类比较多,请教了YRL同学,她给的建议和WZG师弟一样,建议用酒精多洗一遍)。于是下午我提取了第3个组织RNA,这次结果就非常满意,浓度900,纯度1.89,没有三角形标志,真是太开心了。我想明天可以准备进行RT-PCR和q-PCR,毕竟新的引物已经回来了。

    TRIZOL法提组织RNA
    1、组织匀浆
    (1)取出高温高压消毒后研钵,切取50-100mg组织置于研钵内,剪刀剪碎。
    (2)加入600ul的TRIZOL,研磨,直至不见组织碎块,呈匀浆状。加入400ulTRIZOL淋洗研钵。
    (3) 将以上匀浆标本转移到1.5ml的EP管中,在15- 30°C放置5分钟,以彻底分离核蛋白复合体。
    2、相分离
    加入0.2 ml的氯仿,加盖好后涡旋震荡15秒,在15- 30°C放置2-3分钟后离心4℃,12,000rpm,15 minutes 。离心后分成三层,,下层的红色为组织沉渣及酚-氯仿相,中间层为蛋白和DNA,上层是无色的水相,RNA 只存在于水相中。水相占总TRIZOL的40-60%。
    3、RNA沉淀
    将上层水相转移到另一干净的EP管中,(注意宁少勿多,不要取到中间层),加入0.5ml异丙醇,室温静置10 minutes ,然后离心4℃,12,000 rpm,10 minutes。离心后可以在管的侧壁和底部看到白色沉淀,这就是RNA沉淀。
    4、RNA洗涤
    去上清,加入1ml 75%乙醇洗涤RNA沉淀,振荡器混匀,离心,4℃,12000rpm,5 minutes。(可重复多次,彻底洗去有机溶剂)
    5、RNA再溶解
    去上清,置真空或空气中5-10分钟,干燥RNA沉淀。(注意不能将RNA沉淀完全干燥,这样会极大地降低它的溶解度,部份溶解的RNA样品其A260/280 比值< 1.6。)
    用无RNase 水(DEPC)20-50ul重悬RNA沉淀,用枪头反复吹打几次,静置10分钟,55-60°C。测浓度后-20°C保存。
    6、测浓度:以无RNase水(DEPC)作空白对照,测OD260/280值。1 OD=40μg RNA。OD260/280值在1.8-2.0视为纯度很高。一般浓在1000ng/ml 较准。浓度太高要稀释以后再测定。

    下午给140和510换液,里面有许多漂浮的小点点,可晃动,和上回不一样,给他们认真换了液,期待明后天传代会有好的结果。het细胞状态很好,冻存了4管,并其中一瓶T25细胞按1:3传代。

    晚上和几个师弟一起吃饭,互通有无,挺好的!

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