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生物数据库(一)

生物数据库(一)

作者: Peng_001 | 来源:发表于2020-05-14 20:32 被阅读0次

    现存数据库有超过2000种

    分为三类:核酸数据库、蛋白质数据库、专用数据库

    Pubmed 数据库

    索引方法


    pubmed 数据库索引内容如上图所示。
    因此可以根据特定的索引找到相关内容。


    使用精确搜索功能



    Pubmed 也不是万能的。


    genebank

    查看原核生物的基因序列

    locus 相当于身份证号
    accession 相当于学号(不同数据库不一样)


    • 查看基因的详细信息

    翻译产物信息


    同一条基因,还可能有其他潜在翻译产物


    碱基信息


    通过FASTA获取核酸信息

    还可以获得图形化信息


    查看真核细胞基因序列

    跟gene 信息查询到的内容相似

    并非所有数据库的信息都能确保准确


    还有两个新的条目


    gene 序列信息

    mRNA 存在两种:线粒体与真核

    线粒体多了一个翻译为信号肽的mRNA(表示转录为线粒体RNA,最后也会被切除)


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