作业三:linux环境下的软件安装-conda
- conda类似于windows环境下的应用商店,可以通过它安装多种linux软件
- miniconda则是专门用来安装生信相关软件的一个分支conda。
一、conda的安装
- 查看服务器位数
uname -a
- 通过清华镜像网站下载
wget url
. linux的软件后缀为sh - 安装:
bash name.sh
- 激活:
source ~/.bashrc
二、使用conda安装软件
- 添加镜像网站:
conda config --add channels url
- 查看conda的软件列表:
conda list
- 安装软件:
conda install name=version -y
- 卸载软件:
conda remove name -y
三、conda environment配置
- 目的:为了使用不用版本的软件对多种数据进行处理
- 查看目前环境:
conda info --envs
- 创建新的环境:
conda create -n env_name software1 software2=version -y
- 激活环境:
conda activate env_name
- 切换环境:
conda deactive #使当前非base环境失活,从而回到base环境 conda active base #直接激活base环境
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