aspera下载

作者: 苏牧传媒 | 来源:发表于2018-12-11 20:34 被阅读23次

    单个文件下载:

    ascp -i /home/shen/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -k 1 -T -l 100m anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR671/SRR6714645/SRR6714645.sra ./

    多个文件下载:

    for i in 44 45 48 49

    do

    ascp -i /home/shen/.aspera/connect/etc/asperaweb_id_dsa.openssh -k 1 -T -l 100m anonftp@ftp-private.ncbi.nlm.nih.gov:sra/sra-instant/reads/ByRun/sra/SRR/SRR671/SRR67146"$i"/SRR6714"$i".sra ./

    done

    分割SRR文件:

    fastq-dump --split-3 *.sra

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